# emapper version: emapper-2.0.1b-2-g816e190 emapper DB: 2.0 # command: ./emapper.py --cpu 8 -i ./01.processed_data/Puc.pep -m diamond --output Puc --output_dir ./resultes --seed_ortholog_evalue 1e-5 --override --temp_dir ./temp_dir # time: Wed Oct 14 07:31:37 2020 #query_name seed_eggNOG_ortholog seed_ortholog_evalue seed_ortholog_score best_tax_level Preferred_name GOs EC KEGG_ko KEGG_Pathway KEGG_Module KEGG_Reaction KEGG_rclass BRITE KEGG_TC CAZy BiGG_Reaction taxonomic scope eggNOG OGs best eggNOG OG COG Functional cat. eggNOG free text desc. Pdr1g000020 225117.XP_009350472.1 7.8e-230 802.7 fabids Viridiplantae 37SVE@33090,3GEFX@35493,4JFQ3@91835,KOG2922@1,KOG2922@2759 NA|NA|NA P Acts as a Mg(2 ) transporter. Can also transport other divalent cations such as Fe(2 ), Sr(2 ), Ba(2 ), Mn(2 ) and Co(2 ) but to a much less extent than Mg(2 ) Pdr1g000030 3750.XP_008353797.1 6.9e-08 63.5 fabids GO:0003674,GO:0003824,GO:0004177,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005773,GO:0005829,GO:0006508,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008233,GO:0008238,GO:0008239,GO:0016787,GO:0019538,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0070011,GO:0071704,GO:0140096,GO:1901564 Viridiplantae 2QT89@2759,37JK2@33090,3G9XH@35493,4JEEW@91835,COG0494@1 NA|NA|NA L Nudix hydrolase 3-like Pdr1g000040 3750.XP_008393992.1 3.3e-245 854.0 fabids Viridiplantae 37MA7@33090,3G8YI@35493,4JH4B@91835,COG1062@1,KOG0022@2759 NA|NA|NA Q Dehydrogenase Pdr1g000070 225117.XP_009364187.1 0.0 1723.0 fabids 2.3.2.27 ko:K15711 ko00000,ko01000,ko03400,ko04121 Viridiplantae 37IVF@33090,3G7HD@35493,4JDHA@91835,COG0553@1,KOG1001@2759 NA|NA|NA KL SWI SNF-related 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Complex I functions in the transfer of electrons from NADH to the respiratory chain. The immediate electron acceptor for the enzyme is believed to be ubiquinone Pdr1g000250 102107.XP_008240206.1 5.6e-09 68.6 fabids 3.1.3.16 ko:K17500 ko00000,ko01000,ko01009 Viridiplantae 37KWY@33090,3GFY0@35493,4JMDX@91835,COG0631@1,KOG0698@2759 NA|NA|NA T phosphatase 2C Pdr1g000260 225117.XP_009375795.1 1.2e-304 1051.6 fabids GO:0003333,GO:0003674,GO:0005215,GO:0005342,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006820,GO:0006865,GO:0008150,GO:0008509,GO:0008514,GO:0015075,GO:0015171,GO:0015179,GO:0015291,GO:0015297,GO:0015318,GO:0015711,GO:0015807,GO:0015849,GO:0016020,GO:0016021,GO:0022804,GO:0022857,GO:0031224,GO:0031226,GO:0034220,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046942,GO:0046943,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0098656,GO:1902475,GO:1903825,GO:1905039 Viridiplantae 37PBK@33090,3GA0Z@35493,4JRR4@91835,COG0531@1,KOG1289@2759 NA|NA|NA E Amino-acid permease Pdr1g000270 225117.XP_009348349.1 5.7e-106 390.6 fabids GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0009507,GO:0009536,GO:0009579,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 Viridiplantae 28NZN@1,2QVK7@2759,37NHQ@33090,3GD5E@35493,4JJHR@91835 NA|NA|NA S PsbP domain-containing protein Pdr1g000280 225117.XP_009375792.1 3.5e-227 793.9 fabids SRT2 GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0006325,GO:0006464,GO:0006473,GO:0006475,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006952,GO:0006996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009605,GO:0009607,GO:0009617,GO:0009987,GO:0016043,GO:0016569,GO:0016570,GO:0016573,GO:0018193,GO:0018205,GO:0018393,GO:0018394,GO:0019538,GO:0031347,GO:0031348,GO:0036211,GO:0042742,GO:0043170,GO:0043207,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043412,GO:0043543,GO:0043966,GO:0043970,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044424,GO:0044464,GO:0048519,GO:0048583,GO:0048585,GO:0050789,GO:0050896,GO:0051276,GO:0051704,GO:0051707,GO:0061647,GO:0065007,GO:0071704,GO:0071840,GO:0080134,GO:0098542,GO:1901564 ko:K11414 ko00000,ko01000,ko03036 Viridiplantae 37MJD@33090,3GDXY@35493,4JD7X@91835,COG0846@1,KOG2683@2759 NA|NA|NA BK NAD-dependent protein deacylase. Catalyzes the NAD- dependent hydrolysis of acyl groups from lysine residues Pdr1g000290 225117.XP_009351013.1 0.0 1202.6 fabids ko:K18643 ko00000,ko04812 Viridiplantae 37PG3@33090,3GAXY@35493,4JEBD@91835,KOG2489@1,KOG2489@2759 NA|NA|NA S Cleft lip and palate transmembrane protein Pdr1g000300 3750.XP_008348640.1 2.2e-58 232.6 fabids Viridiplantae 37R6P@33090,3G8BW@35493,4JN0G@91835,COG2801@1,KOG0017@2759 NA|NA|NA L Uncharacterized protein K02A2.6-like Pdr1g000320 102107.XP_008223161.1 1.3e-13 82.4 fabids ko:K03978 ko00000,ko03036 Viridiplantae 37WD7@33090,3GJD1@35493,4JQIH@91835,COG1599@1,KOG0851@2759 NA|NA|NA L DNA recombination Pdr1g000330 3750.XP_008364394.1 0.0 2194.9 fabids 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Some of these proteins have been shown both in vivo and in vitro to have ubiquitin E3 ligase activity. 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This endoplasmic reticulum- bound enzymatic process, allows the addition of two carbons to the chain of long- and very long-chain fatty acids VLCFAs per cycle. This enzyme catalyzes the dehydration of the 3-hydroxyacyl-CoA intermediate into trans-2,3-enoyl-CoA, within each cycle of fatty acid elongation. Thereby, it participates to the production of VLCFAs of different chain lengths that are involved in multiple biological processes as precursors of membrane lipids and lipid mediators Pdr1g004440 225117.XP_009364255.1 1.7e-204 718.4 fabids SEX4 GO:0000272,GO:0001871,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005975,GO:0005976,GO:0005982,GO:0005983,GO:0006073,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009057,GO:0009251,GO:0009507,GO:0009532,GO:0009536,GO:0009570,GO:0009987,GO:0016052,GO:0016311,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016791,GO:0019203,GO:0030246,GO:0030247,GO:0042578,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0044042,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044247,GO:0044248,GO:0044260,GO:0044262,GO:0044264,GO:0044275,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044434,GO:0044435,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044464,GO:0071704,GO:0097367,GO:1901575,GO:2001066 Viridiplantae 37MPD@33090,3GFW3@35493,4JEJ1@91835,COG2453@1,KOG1616@1,KOG1616@2759,KOG1716@2759 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genes. Mediator functions as a bridge to convey information from gene-specific regulatory proteins to the basal RNA polymerase II transcription machinery. Mediator is recruited to promoters by direct interactions with regulatory proteins and serves as a scaffold for the assembly of a functional preinitiation complex with RNA polymerase II and the general transcription factors Pdr1g013710 225117.XP_009362726.1 5.2e-242 843.2 fabids GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004352,GO:0004353,GO:0005488,GO:0005507,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005739,GO:0005773,GO:0005774,GO:0006950,GO:0006970,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0009628,GO:0009651,GO:0010035,GO:0010038,GO:0016020,GO:0016491,GO:0016638,GO:0016639,GO:0017076,GO:0030554,GO:0031090,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0035639,GO:0036094,GO:0042221,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044437,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044464,GO:0046686,GO:0046872,GO:0046914,GO:0050896,GO:0050897,GO:0055114,GO:0097159,GO:0097367,GO:0098588,GO:0098805,GO:1901265,GO:1901363 1.4.1.3 ko:K00261 ko00220,ko00250,ko00471,ko00910,ko01100,ko01200,ko04217,ko04964,map00220,map00250,map00471,map00910,map01100,map01200,map04217,map04964 M00740 R00243,R00248 RC00006,RC02799 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko04147 Viridiplantae 37Q3I@33090,3GC9F@35493,4JRW9@91835,COG0334@1,KOG2250@2759 NA|NA|NA E Belongs to the Glu Leu Phe Val dehydrogenases family Pdr1g013720 3750.XP_008375205.1 1.4e-117 429.1 fabids Viridiplantae 2CNCG@1,2QV78@2759,37Q58@33090,3GFZW@35493,4JRXV@91835 NA|NA|NA Pdr1g013730 225117.XP_009362725.1 3.2e-120 438.3 fabids Viridiplantae 37RGI@33090,3GAB5@35493,4JKYB@91835,KOG3102@1,KOG3102@2759 NA|NA|NA J Phosphodiesterase responsible for the U6 snRNA 3' end processing. Acts as an exoribonuclease (RNase) responsible for trimming the poly(U) tract of the last nucleotides in the pre-U6 snRNA molecule, leading to the formation of mature U6 snRNA Pdr1g013740 225117.XP_009362724.1 7.8e-153 546.6 fabids GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005737,GO:0008150,GO:0009507,GO:0009536,GO:0009889,GO:0009891,GO:0009893,GO:0019216,GO:0019222,GO:0019747,GO:0031323,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031328,GO:0031647,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045828,GO:0045834,GO:0046889,GO:0046890,GO:0048518,GO:0048522,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050821,GO:0065007,GO:0065008,GO:0080090,GO:1904143 Viridiplantae 28NS1@1,2QVC3@2759,37KMB@33090,3G77B@35493,4JKR5@91835 NA|NA|NA S Encodes a close homolog of the Cauliflower OR (Orange) protein. The function of OR is to induce the differentiation of proplastids or other noncolored plastids into chromoplasts for carotenoid accumulation. 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important allosteric enzyme in carbohydrate metabolism. Enzymes from different sources differ in their regulatory mechanisms and in their natural substrates. 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8.6e-72 276.6 fabids Viridiplantae 2DF3V@1,2S5RJ@2759,37Z86@33090,3GP2Q@35493,4JUN9@91835 NA|NA|NA Pdr10g005470 3750.XP_008394248.1 9.4e-28 129.4 fabids ko:K17255 ko00000,ko04147 Viridiplantae 37IAP@33090,3GDR2@35493,4JNAH@91835,COG5044@1,KOG1439@2759 NA|NA|NA O Rab GDP-dissociation inhibitor activity Pdr10g005490 225117.XP_009360814.1 5e-170 603.6 fabids 2.4.1.207 ko:K08235 ko00000,ko01000 Viridiplantae 2QQ71@2759,37MSY@33090,3GGN9@35493,4JTRT@91835,COG2273@1 NA|NA|NA G Catalyzes xyloglucan endohydrolysis (XEH) and or endotransglycosylation (XET). Cleaves and religates xyloglucan polymers, an essential constituent of the primary cell wall, and thereby participates in cell wall construction of growing tissues Pdr10g005500 225117.XP_009360959.1 0.0 2300.8 fabids GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 3.6.3.44 ko:K05658 ko02010,ko04976,ko05206,ko05226,map02010,map04976,map05206,map05226 ko00000,ko00001,ko01000,ko02000,ko04090,ko04147 3.A.1.201 Viridiplantae 37HZ5@33090,3G9FQ@35493,4JMK0@91835,COG1132@1,KOG0055@2759 NA|NA|NA Q ABC transporter B family member Pdr10g005510 102107.XP_008242713.1 3.2e-12 77.8 fabids GO:0000209,GO:0000323,GO:0002376,GO:0002495,GO:0002504,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004842,GO:0005102,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005764,GO:0005768,GO:0005773,GO:0006464,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0009987,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0012505,GO:0016567,GO:0016740,GO:0019222,GO:0019538,GO:0019787,GO:0019882,GO:0031410,GO:0031982,GO:0032446,GO:0036211,GO:0042287,GO:0042289,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045346,GO:0045347,GO:0048002,GO:0048519,GO:0050789,GO:0060255,GO:0061630,GO:0061659,GO:0065007,GO:0070647,GO:0071704,GO:0097708,GO:0140096,GO:1901564 Viridiplantae 37RYB@33090,3GG0W@35493,4JMP5@91835,COG5183@1,KOG1609@2759 NA|NA|NA A The RING-variant domain is a C4HC3 zinc-finger like motif found in a number of cellular and viral proteins. Some of these proteins have been shown both in vivo and in vitro to have ubiquitin E3 ligase activity. 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that are reversibly interconvertible by light the Pr form that absorbs maximally in the red region of the spectrum and the Pfr form that absorbs maximally in the far-red region Pdr10g005610 225117.XP_009353845.1 4.5e-258 896.7 fabids GO:0003674,GO:0003824,GO:0004721,GO:0006464,GO:0006470,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016311,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016791,GO:0019538,GO:0036211,GO:0042578,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0071704,GO:0140096,GO:1901564 ko:K17616 ko00000,ko01000,ko01009 Viridiplantae 37PQS@33090,3G7Y9@35493,4JGD2@91835,COG5190@1,KOG1605@2759 NA|NA|NA K CTD small phosphatase-like protein Pdr10g005620 225117.XP_009360831.1 0.0 1801.2 fabids 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37P26@33090,3GD58@35493,4JSCT@91835,KOG0292@1,KOG0292@2759 NA|NA|NA U The coatomer is a cytosolic protein complex that binds to dilysine motifs and reversibly associates with Golgi non- clathrin-coated vesicles, which further mediate biosynthetic protein transport from the ER, via the Golgi up to the trans Golgi network Pdr10g007160 3750.XP_008357585.1 0.0 1109.0 Streptophyta Viridiplantae 2QQPF@2759,37R7I@33090,3GB3T@35493,COG0515@1 NA|NA|NA T Wall-associated receptor kinase Pdr10g007180 3750.XP_008346150.1 0.0 1923.7 fabids 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biosynthetic protein transport from the ER, via the Golgi up to the trans Golgi network Pdr10g007190 3750.XP_008357585.1 3.2e-309 1067.4 Streptophyta Viridiplantae 2QQPF@2759,37R7I@33090,3GB3T@35493,COG0515@1 NA|NA|NA T Wall-associated receptor kinase Pdr10g007230 3750.XP_008358609.1 1.5e-61 242.3 fabids 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biosynthetic protein transport from the ER, via the Golgi up to the trans Golgi network Pdr10g007240 3750.XP_008345294.1 6.5e-66 256.5 fabids GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005794,GO:0005798,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006886,GO:0006888,GO:0006890,GO:0006891,GO:0008104,GO:0008150,GO:0012505,GO:0012506,GO:0015031,GO:0015833,GO:0016020,GO:0016192,GO:0030117,GO:0030120,GO:0030126,GO:0030135,GO:0030137,GO:0030659,GO:0030660,GO:0030662,GO:0030663,GO:0031090,GO:0031410,GO:0031982,GO:0032991,GO:0033036,GO:0034613,GO:0042886,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044431,GO:0044433,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044464,GO:0045184,GO:0046907,GO:0048193,GO:0048475,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051641,GO:0051649,GO:0070727,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0097708,GO:0098588,GO:0098796,GO:0098805 ko:K05236 ko00000,ko04131,ko04147 Viridiplantae 37P26@33090,3GD58@35493,4JSCT@91835,KOG0292@1,KOG0292@2759 NA|NA|NA U The coatomer is a cytosolic protein complex that binds to dilysine motifs and reversibly associates with Golgi non- clathrin-coated vesicles, which further mediate biosynthetic protein transport from the ER, via the Golgi up to the trans Golgi network Pdr10g007250 3750.XP_008357585.1 2.8e-305 1054.3 Streptophyta Viridiplantae 2QQPF@2759,37R7I@33090,3GB3T@35493,COG0515@1 NA|NA|NA T Wall-associated receptor kinase Pdr10g007260 102107.XP_008225633.1 1.5e-298 1031.9 Eukaryota Eukaryota 2QRD1@2759,COG4886@1 NA|NA|NA S specification of plant organ axis polarity Pdr10g007270 102107.XP_008225633.1 1.6e-310 1071.6 Eukaryota Eukaryota 2QRD1@2759,COG4886@1 NA|NA|NA S specification of plant organ axis polarity Pdr10g007280 225117.XP_009370621.1 4.4e-167 594.7 fabids 3.6.4.12 ko:K07466,ko:K15255 ko03030,ko03420,ko03430,ko03440,ko03460,map03030,map03420,map03430,map03440,map03460 M00288 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03000,ko03029,ko03032,ko03400 Viridiplantae 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The coatomer complex is required for budding from Golgi membranes, and is essential for the retrograde Golgi-to-ER transport of dilysine-tagged proteins Pdr10g007630 225117.XP_009353886.1 1.1e-96 359.4 fabids GO:0003674,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0048037,GO:0051536,GO:0051540,GO:0071944 Viridiplantae 2A8UU@1,2RYH6@2759,37UB1@33090,3GI4C@35493,4JP6H@91835 NA|NA|NA S Belongs to the Casparian strip membrane proteins (CASP) family Pdr10g007640 225117.XP_009353887.1 3.6e-40 171.4 fabids LSD1 GO:0008150,GO:0010941,GO:0043067,GO:0043069,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0060548,GO:0065007 Viridiplantae 2CMM6@1,2QQTC@2759,37TUE@33090,3GI9M@35493,4JT6H@91835 NA|NA|NA S LSD1 zinc finger Pdr10g007650 3750.XP_008383445.1 3.1e-207 727.6 fabids Viridiplantae 2CMQF@1,2QRE2@2759,37M45@33090,3GC5Y@35493,4JM3N@91835 NA|NA|NA S protein ROOT PRIMORDIUM DEFECTIVE Pdr10g007660 225117.XP_009353889.1 0.0 2002.3 fabids 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Has also ATPase activity Pdr10g022470 225117.XP_009374168.1 5.1e-56 223.4 fabids ko:K03020 ko00230,ko00240,ko01100,ko03020,ko04623,ko05169,map00230,map00240,map01100,map03020,map04623,map05169 M00181,M00182 R00435,R00441,R00442,R00443 RC02795 br01611,ko00000,ko00001,ko00002,ko03021 Viridiplantae 37VCU@33090,3GJPB@35493,4JPYS@91835,COG1761@1,KOG3438@2759 NA|NA|NA K DNA-directed RNA polymerases I and III subunit Pdr10g022480 3750.XP_008387394.1 6.4e-147 526.9 fabids Viridiplantae 29D32@1,2RK6X@2759,37T6M@33090,3G9EQ@35493,4JS2Z@91835 NA|NA|NA S Hydroxyproline-rich glycoprotein family protein Pdr10g022490 225117.XP_009375837.1 8.1e-37 159.5 Streptophyta Viridiplantae 29D32@1,2S1D9@2759,388SJ@33090,3GXFR@35493 NA|NA|NA Pdr10g022500 3750.XP_008340399.1 2.3e-09 68.6 fabids GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005886,GO:0008150,GO:0010817,GO:0016020,GO:0032879,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0044424,GO:0044464,GO:0050789,GO:0051049,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071944,GO:2000012 Viridiplantae 28JHN@1,2QRWV@2759,37HRT@33090,3GBC2@35493,4JJD4@91835 NA|NA|NA S regulation of auxin polar transport Pdr10g022510 225117.XP_009375812.1 0.0 3307.3 fabids GO:0003674,GO:0003779,GO:0003824,GO:0004430,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005543,GO:0005546,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005886,GO:0005911,GO:0006464,GO:0006468,GO:0006629,GO:0006644,GO:0006650,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006996,GO:0007010,GO:0007154,GO:0007165,GO:0008092,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008289,GO:0009506,GO:0009507,GO:0009536,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016043,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0019538,GO:0019637,GO:0023052,GO:0030029,GO:0030036,GO:0030054,GO:0030258,GO:0035091,GO:0035556,GO:0036211,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044255,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0044877,GO:0046486,GO:0046488,GO:0046834,GO:0046854,GO:0048015,GO:0048017,GO:0048471,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051015,GO:0051716,GO:0052742,GO:0055044,GO:0065007,GO:0070273,GO:0070300,GO:0071704,GO:0071840,GO:0071944,GO:1901564,GO:1901981,GO:1902936 2.7.1.67 ko:K00888 ko00562,ko01100,ko04011,ko04070,map00562,map01100,map04011,map04070 M00130 R03361 RC00002,RC00078 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko04131 Viridiplantae 37Q6R@33090,3GD9S@35493,4JGNQ@91835,COG5032@1,KOG0902@2759 NA|NA|NA T Belongs to the PI3 PI4-kinase family Pdr10g022520 225117.XP_009375811.1 1.5e-47 195.7 fabids Viridiplantae 2DI4U@1,2SDYK@2759,37XKE@33090,3GM2E@35493,4JR9B@91835 NA|NA|NA S Organ-specific protein Pdr10g022530 3750.XP_008387386.1 8.2e-165 586.3 fabids Viridiplantae 28I7F@1,2QU5J@2759,37RE6@33090,3GCNT@35493,4JNRJ@91835 NA|NA|NA S BURP domain-containing protein Pdr10g022540 225117.XP_009375834.1 5.7e-153 547.0 fabids Viridiplantae 28I7F@1,2QU5J@2759,37RE6@33090,3GCNT@35493,4JNRJ@91835 NA|NA|NA S BURP domain-containing protein Pdr10g022550 3760.EMJ02474 2.6e-21 108.6 fabids Viridiplantae 2DI4U@1,2S5XW@2759,37WKR@33090,3GIJG@35493,4JUGF@91835 NA|NA|NA S Organ-specific protein S2 Pdr10g022560 3760.EMJ02474 1.4e-26 125.9 fabids Viridiplantae 2DI4U@1,2S5XW@2759,37WKR@33090,3GIJG@35493,4JUGF@91835 NA|NA|NA S Organ-specific protein S2 Pdr10g022570 3750.XP_008367441.1 8.2e-100 370.9 Streptophyta GO:0005575,GO:0005576,GO:0008150,GO:0010035,GO:0010038,GO:0042221,GO:0046686,GO:0050896 Viridiplantae 2QRA7@2759,37PHN@33090,3G8AA@35493,COG1404@1 NA|NA|NA O cucumisin-like Pdr10g022580 3750.XP_008340701.1 4.9e-07 60.1 fabids Viridiplantae 2CMYU@1,2QSU3@2759,37PJH@33090,3GDDJ@35493,4JNPX@91835 NA|NA|NA S Zinc finger MYM-type protein 1-like Pdr10g022590 225117.XP_009374175.1 0.0 1456.4 fabids ko:K11649 ko04714,ko05225,map04714,map05225 ko00000,ko00001,ko03021,ko03036 Viridiplantae 37NUX@33090,3G7SQ@35493,4JK8W@91835,COG5259@1,KOG1279@2759 NA|NA|NA B SWI SNF complex subunit Pdr10g022600 225117.XP_009374176.1 3.8e-116 424.1 fabids ko:K07897 ko04137,ko04138,ko04140,ko04144,ko04145,ko05132,ko05146,ko05152,map04137,map04138,map04140,map04144,map04145,map05132,map05146,map05152 ko00000,ko00001,ko04031,ko04131,ko04147 Viridiplantae 37IUZ@33090,3GACI@35493,4JMPT@91835,KOG0394@1,KOG0394@2759 NA|NA|NA U Ras-related protein Pdr10g022610 225117.XP_009374196.1 5.4e-253 880.6 fabids Viridiplantae 37SVM@33090,3GBA0@35493,4JE6D@91835,COG0515@1,KOG1187@2759 NA|NA|NA T proline-rich receptor-like protein kinase Pdr10g022620 225117.XP_009374177.1 0.0 1584.3 fabids COPG ko:K17267 ko00000,ko04131,ko04147 Viridiplantae 37K4K@33090,3GFKK@35493,4JNT9@91835,COG5240@1,KOG1078@2759 NA|NA|NA U The coatomer is a cytosolic protein complex that binds to dilysine motifs and reversibly associates with Golgi non- clathrin-coated vesicles, which further mediate biosynthetic protein transport from the ER, via the Golgi up to the trans Golgi network. Coatomer complex is required for budding from Golgi membranes, and is essential for the retrograde Golgi-to-ER transport of dilysine-tagged proteins Pdr10g022630 225117.XP_009374178.1 3.1e-225 787.3 fabids 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Component of the molybdopterin synthase complex that catalyzes the conversion of precursor Z into molybdopterin by mediating the incorporation of 2 sulfur atoms into precursor Z to generate a dithiolene group. In the complex, serves as sulfur donor by being thiocarboxylated (-COSH) at its C-terminus by MOCS3. After interaction with MOCS2B, the sulfur is then transferred to precursor Z to form molybdopterin Pdr10g028430 3750.XP_008381655.1 2.9e-148 531.2 fabids Viridiplantae 37R1N@33090,3G8CS@35493,4JK40@91835,KOG2632@1,KOG2632@2759 NA|NA|NA S Rhomboid protein Pdr10g028440 3750.XP_008358264.1 0.0 1101.3 fabids GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003824,GO:0004518,GO:0004519,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0006139,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009451,GO:0009987,GO:0016070,GO:0016787,GO:0016788,GO:0034641,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046483,GO:0071704,GO:0090304,GO:0090305,GO:0097159,GO:1901360,GO:1901363 Viridiplantae 37M6B@33090,3G866@35493,4JH9R@91835,KOG4197@1,KOG4197@2759 NA|NA|NA L Pentatricopeptide repeat-containing protein Pdr10g028450 3750.XP_008348709.1 0.0 1668.3 Streptophyta 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splice-site and the subsequent assembly of the spliceosome. U1-C is directly involved in initial 5' splice-site recognition for both constitutive and regulated alternative splicing. The interaction with the 5' splice-site seems to precede base-pairing between the pre-mRNA and the U1 snRNA. 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The resulting D-ribose-5- phosphate can then be used either for sythesis of nucleotides, histidine, and tryptophan, or as a component of the pentose phosphate pathway Pdr11g004130 225117.XP_009376702.1 0.0 1089.7 fabids GO:0000003,GO:0003006,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005739,GO:0005829,GO:0007275,GO:0008150,GO:0009507,GO:0009536,GO:0009790,GO:0009791,GO:0009793,GO:0010035,GO:0010038,GO:0010154,GO:0022414,GO:0032501,GO:0032502,GO:0042221,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046686,GO:0048316,GO:0048608,GO:0048731,GO:0048856,GO:0050896,GO:0061458 6.1.1.22 ko:K01893 ko00970,map00970 M00359,M00360 R03648 RC00055,RC00523 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01007,ko03016 Viridiplantae 37JGC@33090,3GDK6@35493,4JGGY@91835,COG0017@1,KOG0554@2759 NA|NA|NA J asparagine--tRNA ligase, cytoplasmic 1-like Pdr11g004140 225117.XP_009344617.1 1.2e-25 122.1 fabids Viridiplantae 2C6FA@1,2SD2E@2759,37XF5@33090,3GMQ0@35493,4JRA7@91835 NA|NA|NA Pdr11g004150 225117.XP_009376705.1 0.0 1228.8 fabids GO:0000165,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004672,GO:0004674,GO:0004707,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005737,GO:0006464,GO:0006468,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0007154,GO:0007165,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0010468,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0019222,GO:0019538,GO:0023014,GO:0023052,GO:0035556,GO:0036211,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044424,GO:0044464,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051716,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0140096,GO:1901564 Viridiplantae 37K2B@33090,3GHNG@35493,4JIVZ@91835,KOG0660@1,KOG0660@2759 NA|NA|NA T mitogen-activated protein kinase Pdr11g004160 225117.XP_009354183.1 1.8e-55 224.2 Streptophyta 1.14.14.19,1.14.14.32 ko:K00512 ko00140,ko01100,ko04913,ko04917,ko04927,ko04934,map00140,map01100,map04913,map04917,map04927,map04934 M00109,M00110 R02211,R03783,R04852,R04853,R08517,R08518 RC00607,RC00660,RC00923,RC01222 ko00000,ko00001,ko00002,ko00199,ko01000 Viridiplantae 37HKM@33090,3G7FU@35493,COG2124@1,COG2801@1,KOG0017@2759,KOG0156@2759 NA|NA|NA Q Belongs to the cytochrome P450 family Pdr11g004170 225117.XP_009376707.1 2.5e-164 584.7 fabids GO:0003674,GO:0003824,GO:0007275,GO:0007568,GO:0008150,GO:0008152,GO:0010150,GO:0016491,GO:0016679,GO:0016682,GO:0032501,GO:0032502,GO:0048366,GO:0048367,GO:0048731,GO:0048827,GO:0048856,GO:0055114,GO:0090693,GO:0099402 Viridiplantae 37SAW@33090,3GA4Z@35493,4JT1Z@91835,COG3491@1,KOG0143@2759 NA|NA|NA Q Belongs to the iron ascorbate-dependent oxidoreductase family Pdr11g004180 225117.XP_009376708.1 4e-209 733.8 fabids GO:0003674,GO:0003824,GO:0007275,GO:0007568,GO:0008150,GO:0008152,GO:0010150,GO:0016491,GO:0016679,GO:0016682,GO:0032501,GO:0032502,GO:0048366,GO:0048367,GO:0048731,GO:0048827,GO:0048856,GO:0055114,GO:0090693,GO:0099402 Viridiplantae 37SAW@33090,3GA4Z@35493,4JT1Z@91835,COG3491@1,KOG0143@2759 NA|NA|NA Q Belongs to the iron ascorbate-dependent oxidoreductase family Pdr11g004190 225117.XP_009376745.1 1.8e-43 181.4 fabids GO:0008150,GO:0009966,GO:0010646,GO:0023051,GO:0030111,GO:0048583,GO:0050789,GO:0050794,GO:0060828,GO:0065007 ko:K11380 ko00000,ko03036 Viridiplantae 37NK8@33090,3GGV1@35493,4JEKZ@91835,COG5141@1,KOG0955@2759 NA|NA|NA S PHD-finger Pdr11g004200 225117.XP_009376720.1 1.1e-198 699.1 fabids GO:0003674,GO:0003824,GO:0007275,GO:0007568,GO:0008150,GO:0008152,GO:0010150,GO:0016491,GO:0016679,GO:0016682,GO:0032501,GO:0032502,GO:0048366,GO:0048367,GO:0048731,GO:0048827,GO:0048856,GO:0055114,GO:0090693,GO:0099402 Viridiplantae 37SAW@33090,3GA4Z@35493,4JT1Z@91835,COG3491@1,KOG0143@2759 NA|NA|NA Q Belongs to the iron ascorbate-dependent oxidoreductase family Pdr11g004210 178901.AmDm5_1575 3.7e-66 258.8 Bacteria ko:K07497 ko00000 Bacteria COG2801@1,COG2801@2 NA|NA|NA L transposition Pdr11g004220 225117.XP_009344612.1 1.3e-63 250.0 fabids GO:0008150,GO:0009966,GO:0010646,GO:0023051,GO:0030111,GO:0048583,GO:0050789,GO:0050794,GO:0060828,GO:0065007 ko:K11380 ko00000,ko03036 Viridiplantae 37NK8@33090,3GGV1@35493,4JEKZ@91835,COG5141@1,KOG0955@2759 NA|NA|NA S PHD-finger Pdr11g004230 225117.XP_009352385.1 7.2e-161 573.2 Streptophyta Viridiplantae 2CYD5@1,2S3NC@2759,380VC@33090,3GKN7@35493 NA|NA|NA S isoform X1 Pdr11g004240 225117.XP_009339320.1 5.6e-58 229.9 Streptophyta Viridiplantae 37K76@33090,3GAQ9@35493,KOG4585@1,KOG4585@2759 NA|NA|NA L nuclease HARBI1 Pdr11g004250 225117.XP_009362154.1 6.7e-22 110.5 fabids Viridiplantae 2BGN3@1,2S19S@2759,37VF0@33090,3GJX2@35493,4JQDK@91835 NA|NA|NA S Four repeated domains in the Fasciclin I family of proteins, present in many other contexts. 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Its presence in a non-photosynthetic plant (Epifagus virginiana) and experiments in tobacco indicate that it has an essential function which is probably not related to photosynthesis Pdr11g007150 4572.TRIUR3_00079-P1 0.0 2162.1 Poales rpoC2 GO:0000428,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0009507,GO:0009536,GO:0030880,GO:0032991,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0061695,GO:1902494,GO:1990234 2.7.7.6 ko:K03046 ko00230,ko00240,ko01100,ko03020,map00230,map00240,map01100,map03020 M00183 R00435,R00441,R00442,R00443 RC02795 br01611,ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03021,ko03400 Viridiplantae 2QPYA@2759,37HSD@33090,3GDVE@35493,3I5C8@38820,3KV60@4447,COG0086@1 NA|NA|NA K DNA-directed RNA polymerase Pdr11g007160 981085.XP_010100012.1 3.2e-102 377.9 fabids atpI 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thiamine precursor thiazole. Catalyzes the conversion of NAD and glycine to adenosine diphosphate 5-(2-hydroxyethyl)-4-methylthiazole-2-carboxylic acid (ADT), an adenylated thiazole intermediate. The reaction includes an iron-dependent sulfide transfer from a conserved cysteine residue of the protein to a thiazole intermediate. The enzyme can only undergo a single turnover, which suggests it is a suicide enzyme. May have additional roles in adaptation to various stress conditions and in DNA damage tolerance Pdr11g008610 225117.XP_009378856.1 1.1e-76 293.5 fabids GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005783,GO:0012505,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 Viridiplantae 37K9J@33090,3G8VP@35493,4JFF6@91835,KOG3054@1,KOG3054@2759 NA|NA|NA S DDRGK domain-containing protein Pdr11g008620 3750.XP_008386000.1 0.0 1411.4 fabids GO:0005575,GO:0016020,GO:0031224,GO:0031225,GO:0044425 Viridiplantae 28M02@1,2QUPM@2759,37KCA@33090,3GD2X@35493,4JDE8@91835 NA|NA|NA S COBRA-like protein Pdr11g008640 225117.XP_009378839.1 4e-253 880.2 fabids 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Complex I functions in the transfer of electrons from NADH to the respiratory chain. 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Also essential during biosynthesis of the molybdenum cofactor. Acts by mediating the C-terminal thiocarboxylation of sulfur carriers URM1 and MOCS2A. Its N-terminus first activates URM1 and MOCS2A as acyl-adenylates (-COAMP), then the persulfide sulfur on the catalytic cysteine is transferred to URM1 and MOCS2A to form thiocarboxylation (-COSH) of their C-terminus. The reaction probably involves hydrogen sulfide that is generated from the persulfide intermediate and that acts as nucleophile towards URM1 and MOCS2A. Subsequently, a transient disulfide bond is formed. 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This endoplasmic reticulum- bound enzymatic process, allows the addition of two carbons to the chain of long- and very long-chain fatty acids VLCFAs per cycle. This enzyme catalyzes the dehydration of the 3-hydroxyacyl-CoA intermediate into trans-2,3-enoyl-CoA, within each cycle of fatty acid elongation. Thereby, it participates to the production of VLCFAs of different chain lengths that are involved in multiple biological processes as precursors of membrane lipids and lipid mediators Pdr11g018170 225117.XP_009338346.1 1.9e-81 308.9 fabids 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Mediates the second step in the final reaction sequence of coenzyme Q (CoQ) biosynthesis, which is the condensation of the polyisoprenoid side chain with PHB, generating the first membrane-bound Q intermediate Pdr11g018360 3760.EMJ09580 1.6e-283 982.2 fabids Viridiplantae 2CND2@1,2QVBR@2759,37TAH@33090,3GHU5@35493,4JSNM@91835 NA|NA|NA S TMV resistance protein N-like Pdr11g018370 225117.XP_009338362.1 2.3e-46 191.8 fabids ko:K11252 ko05034,ko05203,ko05322,map05034,map05203,map05322 ko00000,ko00001,ko03036,ko04147 Viridiplantae 37TXA@33090,3GHYP@35493,4JNU7@91835,KOG1744@1,KOG1744@2759 NA|NA|NA B histone H2B.1 Pdr11g018380 225117.XP_009338374.1 8.1e-54 216.1 fabids ko:K13195 ko00000,ko03041 Viridiplantae 37W18@33090,3GKGY@35493,4JQMM@91835,KOG0118@1,KOG0118@2759 NA|NA|NA A Glycine-rich RNA-binding protein Pdr11g018390 225117.XP_009338378.1 1.3e-68 265.8 fabids 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involved in a number of diverse aspects of plant physiology including growth and development, pest resistance, and senescence or responses to wounding Pdr11g023500 3750.XP_008384457.1 6.6e-17 93.2 fabids TOP6B 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Relaxes both positive and negative superturns and exhibits a strong decatenase activity. 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phenoxy radical-coupling reaction, yielding optically active lignans from two molecules of coniferyl alcohol in the biosynthesis of lignans, flavonolignans, and alkaloids and thus plays a central role in plant secondary metabolism Pdr11g024810 225117.XP_009364102.1 1.5e-100 372.5 fabids Viridiplantae 28PGU@1,2QW4Y@2759,37QMR@33090,3G9C4@35493,4JM53@91835 NA|NA|NA S Family of unknown function (DUF716) Pdr11g024830 225117.XP_009356401.1 7.1e-30 138.3 fabids Viridiplantae 37PCB@33090,3G7N6@35493,4JGMB@91835,KOG2962@1,KOG2962@2759 NA|NA|NA J prohibitin homologues Pdr11g024850 225117.XP_009364115.1 0.0 2336.2 fabids Viridiplantae 37P43@33090,3GF32@35493,4JMAN@91835,KOG4658@1,KOG4658@2759 NA|NA|NA T disease resistance Pdr11g024860 225117.XP_009364164.1 0.0 2199.1 fabids Viridiplantae 37P43@33090,3GF32@35493,4JMAN@91835,KOG4658@1,KOG4658@2759 NA|NA|NA T disease resistance Pdr11g024870 3750.XP_008351737.1 1.6e-122 446.0 fabids 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NA|NA|NA O ATP-dependent serine protease that mediates the selective degradation of misfolded, unassembled or oxidatively damaged polypeptides as well as certain short-lived regulatory proteins in the mitochondrial matrix. May also have a chaperone function in the assembly of inner membrane protein complexes. Participates in the regulation of mitochondrial gene expression and in the maintenance of the integrity of the mitochondrial genome. 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Decreasing the degree of acetylation of pectin gels in vitro alters their physical properties Pdr12g005770 3750.XP_008388909.1 9.7e-276 955.7 fabids ko:K14638 ko00000,ko02000 2.A.17.3 Viridiplantae 37Q3F@33090,3GAUR@35493,4JHK0@91835,COG3104@1,KOG1237@2759 NA|NA|NA E Protein NRT1 PTR FAMILY 4.5-like Pdr12g005780 3750.XP_008364013.1 5.1e-237 827.0 fabids ko:K14638 ko00000,ko02000 2.A.17.3 Viridiplantae 37Q3F@33090,3GAUR@35493,4JHK0@91835,COG3104@1,KOG1237@2759 NA|NA|NA E Protein NRT1 PTR FAMILY 4.5-like Pdr12g005790 3750.XP_008359847.1 0.0 1113.2 fabids GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003824,GO:0004518,GO:0004519,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0006139,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009451,GO:0009987,GO:0016070,GO:0016787,GO:0016788,GO:0034641,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046483,GO:0071704,GO:0090304,GO:0090305,GO:0097159,GO:1901360,GO:1901363 Viridiplantae 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In type I primary cell wall, galacturonic acid residues of pectin can be acetylated at the O-2 and O-3 positions. 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Electrons are transferred to the Fe-S cluster from NADPH via Pdr12g010370 3750.XP_008369733.1 8.5e-157 560.1 fabids Viridiplantae 2CN9P@1,2QUPV@2759,37SVI@33090,3GE3X@35493,4JKZU@91835 NA|NA|NA Pdr12g010380 225117.XP_009342617.1 3.9e-136 491.1 fabids Viridiplantae 28NB5@1,2QUWP@2759,37PQ0@33090,3GG2R@35493,4JFS3@91835 NA|NA|NA S Protamine P1 family protein Pdr12g010390 3750.XP_008360778.1 3.2e-183 648.3 fabids GO:0002229,GO:0002239,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005773,GO:0005886,GO:0006950,GO:0006952,GO:0008150,GO:0009605,GO:0009607,GO:0009617,GO:0016020,GO:0042742,GO:0043207,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051704,GO:0051707,GO:0071944,GO:0098542 Viridiplantae 2QR0Z@2759,37QZE@33090,3GFIA@35493,4JGT2@91835,COG0515@1 NA|NA|NA T L-type lectin-domain containing receptor kinase Pdr12g010420 225117.XP_009358157.1 8.4e-37 159.5 fabids Viridiplantae 2E72I@1,2S9PV@2759,37XED@33090,3GM54@35493,4JR5I@91835 NA|NA|NA 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of cellular and viral proteins. Some of these proteins have been shown both in vivo and in vitro to have ubiquitin E3 ligase activity. 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plastids. 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(a.k.a. 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Required for establishment of the Casparian strip membrane domain (CSD) and the subsequent formation of Casparian strips, a cell wall modification of the root endodermis that determines an apoplastic barrier between the intraorganismal apoplasm and the extraorganismal apoplasm and prevents lateral diffusion (By similarity) Pdr12g019970 225117.XP_009372533.1 7.7e-137 493.4 fabids ko:K12611 ko03018,map03018 M00395 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03019 Viridiplantae 37SUR@33090,3G79R@35493,4JED6@91835,KOG2868@1,KOG2868@2759 NA|NA|NA AK mRNA-decapping enzyme-like Pdr12g019980 225117.XP_009372534.1 3.9e-94 351.7 fabids Viridiplantae 28NKP@1,2QV6F@2759,37PI4@33090,3GB6M@35493,4JIUZ@91835 NA|NA|NA S f-box protein Pdr12g019990 3750.XP_008368111.1 2.6e-18 98.2 Eukaryota Eukaryota KOG1075@1,KOG1075@2759 NA|NA|NA E Ribonuclease H protein Pdr12g020000 225117.XP_009349422.1 0.0 1518.1 fabids Viridiplantae 37NDX@33090,3GCWS@35493,4JESC@91835,KOG1043@1,KOG1043@2759 NA|NA|NA S LETM1-like protein 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It consists of a core antenna complex that captures photons, and an electron transfer chain that converts photonic excitation into a charge separation. 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stereoselectivity on the phenoxy radical-coupling reaction, yielding optically active lignans from two molecules of coniferyl alcohol in the biosynthesis of lignans, flavonolignans, and alkaloids and thus plays a central role in plant secondary metabolism Pdr13g008810 225117.XP_009377452.1 8.6e-102 376.7 fabids Viridiplantae 28KSW@1,2QT90@2759,37P7A@33090,3GB84@35493,4JHRR@91835 NA|NA|NA S Dirigent proteins impart stereoselectivity on the phenoxy radical-coupling reaction, yielding optically active lignans from two molecules of coniferyl alcohol in the biosynthesis of lignans, flavonolignans, and alkaloids and thus plays a central role in plant secondary metabolism Pdr13g008820 225117.XP_009377454.1 2.9e-146 524.6 fabids Viridiplantae 37PYP@33090,3GFWM@35493,4JHAP@91835,KOG2592@1,KOG2592@2759 NA|NA|NA S Serine incorporator Pdr13g008830 225117.XP_009377446.1 0.0 1612.4 fabids ko:K14007 ko04141,map04141 M00404 ko00000,ko00001,ko00002,ko04131 Viridiplantae 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The enzyme does not distinguish between the deoxy- and ribose forms. Probably excludes non-canonical purines from RNA and DNA precursor pools, thus preventing their incorporation into RNA and DNA and avoiding chromosomal lesions Pdr13g008950 225117.XP_009362042.1 1.6e-265 921.4 fabids 4.2.2.2 ko:K01728 ko00040,ko02024,map00040,map02024 R02361,R06240 RC00049,RC00705 ko00000,ko00001,ko01000 Viridiplantae 2QQ5F@2759,37HIU@33090,3G7PT@35493,4JHW8@91835,COG3866@1 NA|NA|NA G Pectate lyase Pdr13g008960 3750.XP_008391435.1 0.0 1154.0 fabids ko:K22390 ko00000 Viridiplantae 37JFP@33090,3GBJW@35493,4JNBR@91835,COG1409@1,KOG1378@2759 NA|NA|NA G Purple acid phosphatase Pdr13g008970 225117.XP_009362038.1 6.4e-190 669.8 fabids GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005911,GO:0009506,GO:0016020,GO:0030054,GO:0044464,GO:0055044,GO:0071944 Viridiplantae 37KG8@33090,3G8DZ@35493,4JEH6@91835,COG0667@1,KOG1575@2759 NA|NA|NA C voltage-gated potassium channel subunit Pdr13g008980 225117.XP_009362079.1 0.0 2243.4 fabids 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Cleaves and religates xyloglucan polymers, an essential constituent of the primary cell wall, and thereby participates in cell wall construction of growing tissues Pdr13g010790 225117.XP_009344498.1 6.3e-193 679.9 fabids Viridiplantae 28NTE@1,2QVDF@2759,37HI3@33090,3GHB8@35493,4JET0@91835 NA|NA|NA S Syntaxin 6, N-terminal Pdr13g010800 3760.EMJ10335 2.6e-19 101.3 fabids 2.3.1.47 ko:K00652 ko00780,ko01100,map00780,map01100 M00123,M00573,M00577 R03210,R10124 RC00004,RC00039,RC02725 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01007 Viridiplantae 37PAF@33090,3GDTC@35493,4JK82@91835,COG0156@1,KOG1359@2759 NA|NA|NA E 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase Pdr13g010810 225117.XP_009349549.1 0.0 1195.6 fabids ko:K10875 ko03440,map03440 ko00000,ko00001,ko01000,ko03400 Viridiplantae 37P80@33090,3GBI1@35493,4JGNW@91835,KOG2398@1,KOG2398@2759 NA|NA|NA D Muniscin C-terminal mu homology domain Pdr13g010830 3750.XP_008359108.1 1.9e-48 200.3 Streptophyta Viridiplantae 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Serves as sulfur donor in tRNA 2- thiolation reaction by being thiocarboxylated (-COSH) at its C- terminus by MOCS3. The sulfur is then transferred to tRNA to form 2-thiolation of mcm(5)S(2)U. Also acts as a ubiquitin-like protein (UBL) that is covalently conjugated via an isopeptide bond to lysine residues of target proteins. 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PSI is a plastocyanin-ferredoxin oxidoreductase, converting photonic excitation into a charge separation, which transfers an electron from the donor P700 chlorophyll pair to the spectroscopically characterized acceptors A0, A1, FX, FA and FB in turn Pdr13g014270 3659.XP_004174064.1 1.6e-43 181.8 fabids ndhE GO:0003674,GO:0003824,GO:0003954,GO:0003959,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006732,GO:0006733,GO:0006743,GO:0006744,GO:0008137,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009507,GO:0009534,GO:0009535,GO:0009536,GO:0009579,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016491,GO:0016651,GO:0016655,GO:0030964,GO:0031976,GO:0031984,GO:0032991,GO:0034357,GO:0042180,GO:0042181,GO:0042651,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044434,GO:0044435,GO:0044436,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044464,GO:0050136,GO:0051186,GO:0051188,GO:0055035,GO:0055114,GO:0071704,GO:0098796,GO:1901576,GO:1901661,GO:1901663,GO:1902494 1.6.5.3 ko:K05576 ko00190,ko01100,map00190,map01100 M00145 R11945 RC00061 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Viridiplantae 37V63@33090,3GJK7@35493,4JUUQ@91835,KOG4669@1,KOG4669@2759 NA|NA|NA C NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 4L Pdr13g014280 981085.XP_010098680.1 1.7e-75 288.9 fabids ndhG GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0015979,GO:0044237 1.6.5.3 ko:K05578 ko00190,ko01100,map00190,map01100 M00145 R11945 RC00061 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Viridiplantae 2QQHR@2759,37N23@33090,3GCEY@35493,4JS5P@91835,COG0839@1 NA|NA|NA C Belongs to the complex I subunit 6 family Pdr13g014290 3702.ATCG01090.1 2.9e-58 231.5 Streptophyta ndhI GO:0003674,GO:0003824,GO:0003959,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009507,GO:0009534,GO:0009535,GO:0009536,GO:0009579,GO:0009987,GO:0015979,GO:0016020,GO:0016491,GO:0016651,GO:0031976,GO:0031984,GO:0034357,GO:0042651,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0044237,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044434,GO:0044435,GO:0044436,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044464,GO:0055035,GO:0055114 1.6.5.3 ko:K05580 ko00190,ko01100,map00190,map01100 M00145 R11945 RC00061 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Viridiplantae 37YQF@33090,3GCUY@35493,COG1143@1,KOG3256@2759 NA|NA|NA C NDH shuttles electrons from NAD(P)H plastoquinone, via FMN and iron-sulfur (Fe-S) centers, to quinones in the photosynthetic chain and possibly in a chloroplast respiratory chain. The immediate electron acceptor for the enzyme in this species is believed to be plastoquinone. 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The immediate electron acceptor for the enzyme in this species is believed to be plastoquinone. Couples the redox reaction to proton translocation, and thus conserves the redox energy in a proton gradient Pdr13g014310 3880.AES86356 1.2e-219 768.8 fabids ndhH GO:0003674,GO:0003824,GO:0003959,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005739,GO:0005740,GO:0005743,GO:0005746,GO:0005747,GO:0006091,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009507,GO:0009532,GO:0009534,GO:0009535,GO:0009536,GO:0009570,GO:0009579,GO:0009987,GO:0015979,GO:0015980,GO:0016020,GO:0016491,GO:0016651,GO:0019866,GO:0030964,GO:0031090,GO:0031966,GO:0031967,GO:0031975,GO:0031976,GO:0031984,GO:0032991,GO:0034357,GO:0042651,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0044237,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044429,GO:0044434,GO:0044435,GO:0044436,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044455,GO:0044464,GO:0045271,GO:0045333,GO:0055035,GO:0055114,GO:0070469,GO:0098796,GO:0098798,GO:0098800,GO:0098803,GO:1902494,GO:1990204 1.6.5.3 ko:K05572,ko:K05579 ko00190,ko01100,map00190,map01100 M00145 R11945 RC00061 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Viridiplantae 37KKG@33090,3GDNP@35493,4JSZT@91835,COG0649@1,COG1005@1,COG1143@1,KOG2870@2759,KOG3256@2759,KOG4770@2759 NA|NA|NA C NDH shuttles electrons from NAD(P)H plastoquinone, via FMN and iron-sulfur (Fe-S) centers, to quinones in the photosynthetic chain and possibly in a chloroplast respiratory chain. 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Viridiplantae 29XXM@1,2RXST@2759,37U45@33090,3GHW8@35493,4JSUE@91835 NA|NA|NA S Dirigent proteins impart stereoselectivity on the phenoxy radical-coupling reaction, yielding optically active lignans from two molecules of coniferyl alcohol in the biosynthesis of lignans, flavonolignans, and alkaloids and thus plays a central role in plant secondary metabolism Pdr14g003100 225117.XP_009349710.1 2.5e-59 235.7 fabids ko:K02889 ko03010,map03010 M00177,M00179 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Viridiplantae 37P3J@33090,3GBHC@35493,4JEU5@91835,COG2139@1,KOG1732@2759 NA|NA|NA J 60S ribosomal protein Pdr14g003130 3750.XP_008367263.1 4.8e-90 337.0 fabids ko:K02889 ko03010,map03010 M00177,M00179 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Viridiplantae 37P3J@33090,3GBHC@35493,4JEU5@91835,COG2139@1,KOG1732@2759 NA|NA|NA J 60S ribosomal protein Pdr14g003140 3750.XP_008370956.1 6.9e-59 234.2 fabids 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with Arg, Phe, Tyr, Leu, and Glu adjacent to the leaving group at neutral or slightly basic pH Pdr14g008720 225117.XP_009350625.1 1.9e-138 498.4 fabids PAG1 GO:0000502,GO:0005575,GO:0005576,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005737,GO:0005773,GO:0005774,GO:0005829,GO:0005839,GO:0006950,GO:0008150,GO:0009266,GO:0009409,GO:0009628,GO:0010035,GO:0010038,GO:0016020,GO:0019773,GO:0031090,GO:0032991,GO:0042221,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044437,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044464,GO:0046686,GO:0048046,GO:0050896,GO:0098588,GO:0098805,GO:1902494,GO:1905368,GO:1905369 3.4.25.1 ko:K02727 ko03050,map03050 M00337,M00340 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01002,ko03051 Viridiplantae 37HKE@33090,3G96Z@35493,4JKH8@91835,COG0638@1,KOG0184@2759 NA|NA|NA O The proteasome is a multicatalytic proteinase complex which is characterized by its ability to cleave peptides with Arg, Phe, Tyr, Leu, and Glu adjacent to the leaving group at neutral or slightly basic pH 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CDPK-related kinase Pdr14g008980 225117.XP_009379058.1 1.5e-50 206.1 fabids ko:K20661 ko00000,ko00199 Viridiplantae 37IE9@33090,3G9JY@35493,4JNSH@91835,COG2124@1,KOG0157@2759 NA|NA|NA IQ Cytochrome p450 Pdr14g008990 225117.XP_009350864.1 1.7e-123 448.7 fabids GO:0003674,GO:0003700,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005737,GO:0006355,GO:0006950,GO:0006970,GO:0006972,GO:0008150,GO:0009507,GO:0009526,GO:0009536,GO:0009628,GO:0009651,GO:0009889,GO:0009941,GO:0010033,GO:0010200,GO:0010243,GO:0010468,GO:0010556,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031326,GO:0031967,GO:0031975,GO:0042221,GO:0042493,GO:0042538,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044434,GO:0044435,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044464,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051171,GO:0051252,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:0140110,GO:1901698,GO:1901700,GO:1903506,GO:2000112,GO:2001141 ko:K22484 ko00000,ko03000 Viridiplantae 37RVU@33090,3GDUW@35493,4JSE5@91835,KOG3561@1,KOG3561@2759 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Belongs to the DHHC palmitoyltransferase family Pdr14g009130 3750.XP_008364001.1 6.7e-80 304.7 Viridiplantae Viridiplantae 37THH@33090,COG2801@1,KOG0017@2759 NA|NA|NA L Mitochondrial protein Pdr14g009140 3750.XP_008392508.1 1.8e-179 635.2 fabids GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0003973,GO:0005488,GO:0008150,GO:0008152,GO:0016491,GO:0016614,GO:0016899,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0047545,GO:0048037,GO:0050660,GO:0050662,GO:0055114,GO:0071949,GO:0097159,GO:1901265,GO:1901363 Viridiplantae 37NGA@33090,3GDP3@35493,4JKUD@91835,COG0579@1,KOG2665@2759 NA|NA|NA L L-2-hydroxyglutarate dehydrogenase Pdr14g009150 225117.XP_009344982.1 1.3e-276 958.4 fabids 3.4.22.34 ko:K01369 ko04142,ko04612,map04142,map04612 ko00000,ko00001,ko01000,ko01002 Viridiplantae 37PUU@33090,3GBF5@35493,4JJW9@91835,COG5206@1,KOG1348@2759 NA|NA|NA O cysteine-type peptidase activity Pdr14g009160 102107.XP_008240643.1 3.6e-52 211.1 Streptophyta 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NA|NA|NA T Calmodulin mediates the control of a large number of enzymes, ion channels and other proteins by Ca(2 ). Among the enzymes to be stimulated by the calmodulin-Ca(2 ) complex are a number of protein kinases and phosphatases Pdr14g009170 225117.XP_009344978.1 6.2e-127 460.3 fabids UBC22 GO:0000209,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004842,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005737,GO:0006464,GO:0006508,GO:0006511,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009057,GO:0009987,GO:0016567,GO:0016740,GO:0019538,GO:0019787,GO:0019899,GO:0019941,GO:0030163,GO:0031625,GO:0032446,GO:0036211,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043412,GO:0043632,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044257,GO:0044260,GO:0044265,GO:0044267,GO:0044389,GO:0044424,GO:0044464,GO:0051603,GO:0061630,GO:0061659,GO:0070647,GO:0071704,GO:0140096,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575 2.3.2.23 ko:K10583 ko04120,map04120 ko00000,ko00001,ko01000,ko04121 Viridiplantae 37KDU@33090,3GCNI@35493,4JHI2@91835,COG5078@1,KOG0423@2759 NA|NA|NA O Belongs to the ubiquitin-conjugating enzyme family 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alcohol in the biosynthesis of lignans, flavonolignans, and alkaloids and thus plays a central role in plant secondary metabolism Pdr14g012280 225117.XP_009333977.1 8.5e-24 118.2 Streptophyta ko:K05391 ko04626,map04626 ko00000,ko00001,ko04040 1.A.1.5 Viridiplantae 37Q35@33090,3GAHY@35493,KOG0498@1,KOG0498@2759 NA|NA|NA PT Cyclic nucleotide-gated ion channel 1-like Pdr14g012290 3750.XP_008341336.1 4.5e-71 273.9 fabids GO:0003674,GO:0006725,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009698,GO:0009699,GO:0009806,GO:0009807,GO:0009987,GO:0018130,GO:0018904,GO:0018958,GO:0019438,GO:0019748,GO:0030234,GO:0042349,GO:0042537,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044550,GO:0046189,GO:0046483,GO:0050790,GO:0065007,GO:0065009,GO:0071704,GO:0098772,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901503,GO:1901576,GO:1901598,GO:1901599,GO:1901615,GO:1901617 Viridiplantae 29XXM@1,2RXV9@2759,37UBB@33090,3GI0H@35493,4JTJ2@91835 NA|NA|NA S Dirigent proteins impart stereoselectivity on the phenoxy radical-coupling reaction, 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Some of these proteins have been shown both in vivo and in vitro to have ubiquitin E3 ligase activity. 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The complex is associated with the Golgi region as well as more peripheral structures. It facilitates the budding of vesicles from the Golgi membrane and may be directly involved in trafficking to the vacuole. It also function in maintaining the identity of lytic vacuoles and in regulating the transition between storage and lytic vacuoles Pdr14g019120 225117.XP_009360138.1 0.0 2476.8 fabids 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The proton acceptor active site deprotonates the incoming queuine, allowing a nucleophilic attack on the C1' of the ribose to form the product Pdr15g001810 225117.XP_009373216.1 0.0 1836.2 fabids Viridiplantae 2CND2@1,2QVBR@2759,37TAH@33090,3GHU5@35493,4JSNM@91835 NA|NA|NA S TMV resistance protein N-like Pdr15g001820 3750.XP_008351316.1 0.0 1806.2 fabids Viridiplantae 2CND2@1,2QVBR@2759,37TAH@33090,3GHU5@35493,4JSNM@91835 NA|NA|NA S TMV resistance protein N-like Pdr15g001830 3750.XP_008342525.1 0.0 1256.1 fabids Viridiplantae 2CND2@1,2QVBR@2759,37TAH@33090,3GHU5@35493,4JSNM@91835 NA|NA|NA S TMV resistance protein N-like Pdr15g001840 225117.XP_009373237.1 3.4e-233 813.9 fabids GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005739,GO:0005740,GO:0005741,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008479,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016020,GO:0016070,GO:0016740,GO:0016757,GO:0016763,GO:0019867,GO:0031090,GO:0031966,GO:0031967,GO:0031968,GO:0031975,GO:0032991,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0042802,GO:0042803,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044429,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044464,GO:0046483,GO:0046982,GO:0046983,GO:0071704,GO:0090304,GO:0098588,GO:0098805,GO:0101030,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901360 2.4.2.29 ko:K00773 R03789,R10209 RC00063 ko00000,ko01000,ko03016 Viridiplantae 37JUI@33090,3GBFW@35493,4JEH9@91835,COG0343@1,KOG3908@2759 NA|NA|NA A Catalytic subunit of the queuine tRNA-ribosyltransferase (TGT) that catalyzes the base-exchange of a guanine (G) residue with queuine (Q) at position 34 (anticodon wobble position) in tRNAs with GU(N) anticodons (tRNA-Asp, -Asn, -His and -Tyr), resulting in the hypermodified nucleoside queuosine (7-(((4,5-cis- dihydroxy-2-cyclopenten-1-yl)amino)methyl)-7-deazaguanosine). Catalysis occurs through a double-displacement mechanism. The nucleophile active site attacks the C1' of nucleotide 34 to detach the guanine base from the RNA, forming a covalent enzyme-RNA intermediate. 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Some of these proteins have been shown both in vivo and in vitro to have ubiquitin E3 ligase activity. 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This endoplasmic reticulum- bound enzymatic process, allows the addition of two carbons to the chain of long- and very long-chain fatty acids VLCFAs per cycle. This enzyme catalyzes the dehydration of the 3-hydroxyacyl-CoA intermediate into trans-2,3-enoyl-CoA, within each cycle of fatty acid elongation. Thereby, it participates to the production of VLCFAs of different chain lengths that are involved in multiple biological processes as precursors of membrane lipids and lipid mediators Pdr15g007060 225117.XP_009345717.1 3.2e-214 750.7 fabids SEX4 GO:0000272,GO:0001871,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005975,GO:0005976,GO:0005982,GO:0005983,GO:0006073,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009057,GO:0009251,GO:0009507,GO:0009532,GO:0009536,GO:0009570,GO:0009987,GO:0016052,GO:0016311,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016791,GO:0019203,GO:0030246,GO:0030247,GO:0042578,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0044042,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044247,GO:0044248,GO:0044260,GO:0044262,GO:0044264,GO:0044275,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044434,GO:0044435,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044464,GO:0071704,GO:0097367,GO:1901575,GO:2001066 Viridiplantae 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the ER, via the Golgi up to the trans Golgi network. 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The scissile phosphodiester is attacked by the catalytic tyrosine of the enzyme, resulting in the formation of a DNA-(5'-phosphotyrosyl)-enzyme intermediate and the expulsion of a 3'-OH DNA strand Pdr15g021400 225117.XP_009355897.1 1.7e-72 279.3 fabids GO:0003674,GO:0003700,GO:0006355,GO:0008150,GO:0009889,GO:0010468,GO:0010556,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031326,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051252,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:0140110,GO:1903506,GO:2000112,GO:2001141 ko:K08065 ko04612,ko05152,ko05166,map04612,map05152,map05166 ko00000,ko00001,ko03000 Viridiplantae 37QVT@33090,3GGVC@35493,4JFJN@91835,COG2036@1,KOG0869@2759 NA|NA|NA B protein heterodimerization activity Pdr15g021410 225117.XP_009355841.1 0.0 1352.4 fabids 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Required for the import of protein into the nucleus and also for RNA export. Involved in chromatin condensation and control of cell cycle Pdr15g023000 225117.XP_009345289.1 1.6e-210 738.4 fabids Viridiplantae 2CGU3@1,2QRP6@2759,37QPU@33090,3GAWZ@35493,4JDAJ@91835 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF642) Pdr15g023010 225117.XP_009334780.1 6.4e-63 246.5 fabids GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005739,GO:0005740,GO:0005743,GO:0016020,GO:0019866,GO:0031090,GO:0031966,GO:0031967,GO:0031975,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044429,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044464 ko:K00417 ko00190,ko01100,ko04260,ko04714,ko04932,ko05010,ko05012,ko05016,map00190,map01100,map04260,map04714,map04932,map05010,map05012,map05016 M00152 ko00000,ko00001,ko00002 Viridiplantae 37UVF@33090,3GIRI@35493,4JPD5@91835,KOG3440@1,KOG3440@2759 NA|NA|NA C Component of the ubiquinol-cytochrome c reductase complex (complex III or cytochrome b-c1 complex), which is part of the mitochondrial respiratory chain Pdr15g023020 3750.XP_008337117.1 2.3e-24 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37MAM@33090,3G8RS@35493,4JE4K@91835,KOG0988@1,KOG0988@2759 NA|NA|NA A Probably involved in the RNA silencing pathway and required for the generation of small interfering RNAs (siRNAs) Pdr16g003470 225117.XP_009356263.1 2.3e-134 485.0 fabids PRPL15 GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0009507,GO:0009536,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 ko:K02876 ko03010,map03010 M00178,M00179 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Viridiplantae 37P2T@33090,3GH06@35493,4JNMY@91835,COG0200@1,KOG0846@2759 NA|NA|NA J Belongs to the universal ribosomal protein uL15 family Pdr16g003480 225117.XP_009356264.1 1.9e-92 345.1 fabids Viridiplantae 2C4BW@1,2RYSF@2759,37UCT@33090,3GIGF@35493,4JTX4@91835 NA|NA|NA Pdr16g003490 225117.XP_009356265.1 2.1e-96 358.2 fabids Viridiplantae 2C4BW@1,2RYSF@2759,37UCT@33090,3GIGF@35493,4JTX4@91835 NA|NA|NA Pdr16g003500 3750.XP_008351021.1 1.9e-49 201.8 fabids Viridiplantae 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Enzymes from different sources differ in their regulatory mechanisms and in their natural substrates. However, all known phosphorylases share catalytic and structural properties Pdr16g005380 3750.XP_008361774.1 2.6e-103 381.7 fabids SNAP30 GO:0003674,GO:0005484,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0008150,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016043,GO:0016192,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051234,GO:0061024,GO:0061025,GO:0071840,GO:0071944 ko:K18211 ko04721,ko04911,map04721,map04911 ko00000,ko00001,ko04131 Viridiplantae 37NC6@33090,3GDAR@35493,4JI7S@91835,KOG3065@1,KOG3065@2759 NA|NA|NA U SNAP25 homologous protein Pdr16g005390 3750.XP_008361878.1 4.9e-67 260.4 Viridiplantae GO:0003674,GO:0005102,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005576,GO:0007154,GO:0007267,GO:0008150,GO:0009987,GO:0023052,GO:0030154,GO:0032502,GO:0033612,GO:0045165,GO:0045168,GO:0048046,GO:0048869 Viridiplantae 2E2JX@1,2S9T8@2759,37X1I@33090 NA|NA|NA S CLAVATA3 ESR (CLE)-related protein Pdr16g005400 3750.XP_008361775.1 3.5e-63 248.8 fabids Viridiplantae 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The immediate electron acceptor for the enzyme in this species is believed to be plastoquinone. 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The reaction takes place in the presence of glutamine and ATP through an activated gamma-phospho- Glu-tRNA(Gln) Pdr16g016410 225117.XP_009358048.1 2.3e-261 907.5 fabids 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Cleaves and religates xyloglucan polymers, an essential constituent of the primary cell wall, and thereby participates in cell wall construction of growing tissues Pdr16g020970 225117.XP_009351639.1 1.4e-82 313.2 fabids GO:0000018,GO:0000228,GO:0000729,GO:0000785,GO:0000792,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005657,GO:0005694,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006281,GO:0006302,GO:0006325,GO:0006338,GO:0006355,GO:0006464,GO:0006476,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0006996,GO:0007049,GO:0007059,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009117,GO:0009314,GO:0009411,GO:0009416,GO:0009628,GO:0009889,GO:0009891,GO:0009893,GO:0009987,GO:0010225,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010604,GO:0010628,GO:0016043,GO:0016363,GO:0016569,GO:0016570,GO:0016575,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019538,GO:0019637,GO:0022402,GO:0022607,GO:0031323,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031328,GO:0031974,GO:0031981,GO:0033554,GO:0034399,GO:0034641,GO:0034644,GO:0035601,GO:0035861,GO:0036211,GO:0043044,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043232,GO:0043233,GO:0043412,GO:0043596,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044281,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044427,GO:0044428,GO:0044446,GO:0044454,GO:0044464,GO:0045893,GO:0045935,GO:0046483,GO:0048518,GO:0048522,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051052,GO:0051171,GO:0051173,GO:0051252,GO:0051254,GO:0051259,GO:0051260,GO:0051276,GO:0051304,GO:0051716,GO:0055086,GO:0060255,GO:0065003,GO:0065007,GO:0070013,GO:0070932,GO:0070933,GO:0071214,GO:0071478,GO:0071482,GO:0071494,GO:0071704,GO:0071840,GO:0080090,GO:0090304,GO:0090734,GO:0097159,GO:0098732,GO:0104004,GO:1901360,GO:1901363,GO:1901564,GO:1902680,GO:1903506,GO:1903508,GO:2000112,GO:2001141 3.6.4.12 ko:K14439 ko04550,map04550 ko00000,ko00001,ko01000,ko03036 Viridiplantae 37SNU@33090,3GGHE@35493,4JMIH@91835,KOG0389@1,KOG0389@2759 NA|NA|NA B SWI SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD H box Pdr16g020980 225117.XP_009341219.1 1.7e-210 738.4 fabids Viridiplantae 28N5V@1,2QUR3@2759,37KWF@33090,3GDSD@35493,4JF91@91835 NA|NA|NA Pdr16g020990 3750.XP_008348469.1 0.0 1693.3 fabids GO:0000002,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005777,GO:0005782,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006508,GO:0006605,GO:0006625,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006810,GO:0006886,GO:0006950,GO:0006996,GO:0007005,GO:0007031,GO:0007275,GO:0008104,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009266,GO:0009408,GO:0009628,GO:0009791,GO:0009987,GO:0010467,GO:0015031,GO:0015833,GO:0015919,GO:0016043,GO:0016485,GO:0016558,GO:0016560,GO:0017038,GO:0019538,GO:0022622,GO:0031907,GO:0031974,GO:0032042,GO:0032501,GO:0032502,GO:0033036,GO:0033365,GO:0034613,GO:0034641,GO:0040007,GO:0042579,GO:0042886,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043233,GO:0043574,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044438,GO:0044439,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044464,GO:0044743,GO:0045184,GO:0046483,GO:0046907,GO:0048364,GO:0048527,GO:0048528,GO:0048731,GO:0048856,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051604,GO:0051641,GO:0051649,GO:0055085,GO:0065002,GO:0070013,GO:0070727,GO:0071702,GO:0071704,GO:0071705,GO:0071806,GO:0071840,GO:0072594,GO:0072662,GO:0072663,GO:0090304,GO:0090696,GO:0099402,GO:1901360,GO:1901564 3.4.21.53 ko:K01338 ko04112,map04112 ko00000,ko00001,ko01000,ko01002 Viridiplantae 37QRW@33090,3GCYG@35493,4JJKB@91835,COG0466@1,KOG2004@2759 NA|NA|NA O ATP-dependent serine protease that mediates the selective degradation of misfolded and unassembled polypeptides in the peroxisomal matrix. 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Cleaves and religates xyloglucan polymers, an essential constituent of the primary cell wall, and thereby participates in cell wall construction of growing tissues Pdr16g022160 3750.XP_008373529.1 3.9e-99 368.2 fabids Viridiplantae 2CMZW@1,2QT0G@2759,37S16@33090,3GFGX@35493,4JH1Z@91835 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF760) Pdr16g022170 29760.VIT_07s0005g06030.t01 2.6e-192 679.1 Streptophyta 3.6.4.12 ko:K20093 ko00000,ko01000,ko03036 Viridiplantae 37THH@33090,3GG2K@35493,COG2801@1,KOG0017@2759 NA|NA|NA O Mitochondrial protein Pdr16g022180 3750.XP_008341061.1 3.7e-128 464.5 fabids GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003700,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0006355,GO:0008150,GO:0009889,GO:0009891,GO:0009893,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010604,GO:0010628,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031328,GO:0042802,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043565,GO:0044424,GO:0044464,GO:0045893,GO:0045935,GO:0048518,GO:0048522,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051173,GO:0051252,GO:0051254,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:0097159,GO:0140110,GO:1901363,GO:1902680,GO:1903506,GO:1903508,GO:2000112,GO:2001141 ko:K09060 ko00000,ko03000 Viridiplantae 28N11@1,2QUJX@2759,37MSU@33090,3GE8Q@35493,4JDCN@91835 NA|NA|NA K transcription factor Pdr16g022190 225117.XP_009344141.1 4.9e-241 840.1 fabids GPAT GO:0003674,GO:0003824,GO:0004366,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006629,GO:0006644,GO:0006650,GO:0006655,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008374,GO:0008610,GO:0008654,GO:0009058,GO:0009507,GO:0009532,GO:0009536,GO:0009570,GO:0009987,GO:0016740,GO:0016746,GO:0016747,GO:0019637,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044434,GO:0044435,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044464,GO:0045017,GO:0046471,GO:0046474,GO:0046486,GO:0071704,GO:0090407,GO:1901576 2.3.1.15 ko:K00630 ko00561,ko00564,ko01100,ko01110,map00561,map00564,map01100,map01110 M00089 R00851,R09380 RC00004,RC00039,RC00041 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01004 iRC1080.CRv4_Au5_s2_g9657_t1 Viridiplantae 28J58@1,2QRHE@2759,37IRW@33090,3GAB9@35493,4JI9Q@91835 NA|NA|NA I Esterifies acyl-group from acyl-ACP to the sn-1 position of glycerol-3-phosphate. 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The eIF-3 complex specifically targets and initiates translation of a subset of mRNAs involved in cell proliferation Pdr16g022210 225117.XP_009344144.1 3.7e-184 651.0 Streptophyta GO:0000003,GO:0001067,GO:0003002,GO:0003006,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003700,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0006355,GO:0007275,GO:0007389,GO:0008150,GO:0009791,GO:0009798,GO:0009889,GO:0009908,GO:0009943,GO:0009944,GO:0009955,GO:0010468,GO:0010556,GO:0019219,GO:0019222,GO:0022414,GO:0031323,GO:0031326,GO:0032501,GO:0032502,GO:0035670,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0044212,GO:0044424,GO:0044464,GO:0048367,GO:0048437,GO:0048438,GO:0048440,GO:0048467,GO:0048481,GO:0048608,GO:0048731,GO:0048827,GO:0048856,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051252,GO:0060255,GO:0061458,GO:0065001,GO:0065007,GO:0080090,GO:0090567,GO:0097159,GO:0099402,GO:0140110,GO:1901363,GO:1903506,GO:2000112,GO:2001141 Viridiplantae 28J99@1,2QRMZ@2759,37RKY@33090,3GFNM@35493 NA|NA|NA K 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Probable Rab-GAPs. 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Can also transport other divalent cations such as Fe(2 ), Sr(2 ), Ba(2 ), Mn(2 ) and Co(2 ) but to a much less extent than Mg(2 ) Pdr17g000090 225117.XP_009378066.1 4.6e-166 590.5 fabids Viridiplantae 28KYS@1,2QTFJ@2759,37T3A@33090,3G96R@35493,4JHMN@91835 NA|NA|NA S Family of unknown function (DUF716) Pdr17g000100 225117.XP_009378064.1 4.6e-122 444.1 fabids Viridiplantae 37SS2@33090,3GF86@35493,4JMKR@91835,COG5325@1,KOG0811@2759 NA|NA|NA HMU Glycosyltransferase like family Pdr17g000110 225117.XP_009378065.1 0.0 1605.5 fabids Viridiplantae 37P6Z@33090,3G94B@35493,4JGF0@91835,KOG0344@1,KOG0344@2759 NA|NA|NA A CarD-like/TRCF domain Pdr17g000120 225117.XP_009378062.1 7.3e-86 323.2 fabids GO:0005575,GO:0016020,GO:0031224,GO:0031225,GO:0044425 Viridiplantae 2CNJ9@1,2S410@2759,37VYS@33090,3GKDH@35493,4JQTZ@91835 NA|NA|NA T Belongs to the plant LTP family Pdr17g000130 225117.XP_009378061.1 0.0 1507.3 fabids 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Subunit C is necessary for the assembly of the catalytic sector of the enzyme and is likely to have a specific function in its catalytic activity. 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Required for maturation of extramitochondrial Fe-S proteins. Functions as Fe-S scaffold, mediating the de novo assembly of an Fe-S cluster and its transfer to target apoproteins. 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It catalyzes the synthesis of the activated glycosyl donor, ADP- glucose from Glc-1-P and ATP Pdr17g007350 3750.XP_008353619.1 1.2e-63 249.2 fabids Viridiplantae 28Q20@1,2QWQP@2759,37T9P@33090,3GDHQ@35493,4JP0T@91835 NA|NA|NA Pdr17g007360 225117.XP_009377938.1 4.4e-288 996.5 fabids 2.4.1.324 ko:K21374 ko00000,ko01000,ko01003 GT1 Viridiplantae 37YWK@33090,3GNTU@35493,4JRBN@91835,KOG1192@1,KOG1192@2759 NA|NA|NA CG UDP-Glycosyltransferase Pdr17g007370 225117.XP_009377931.1 9.6e-234 815.8 fabids 2.4.1.324 ko:K21374 ko00000,ko01000,ko01003 GT1 Viridiplantae 37YWK@33090,3GNTU@35493,4JRBN@91835,KOG1192@1,KOG1192@2759 NA|NA|NA CG UDP-Glycosyltransferase Pdr17g007380 225117.XP_009356180.1 5.2e-08 64.3 fabids ko:K20784 ko00514,map00514 ko00000,ko00001,ko01000,ko01003 GT77 Viridiplantae 2QQ7C@2759,37SP4@33090,3GAIF@35493,4JNHE@91835,COG0543@1 NA|NA|NA CH Fruit protein Pdr17g007400 3750.XP_008339708.1 2e-13 82.0 fabids 3.4.23.25,3.4.23.5 ko:K01379,ko:K01381 ko04071,ko04138,ko04140,ko04142,ko04210,ko04915,ko05152,map04071,map04138,map04140,map04142,map04210,map04915,map05152 ko00000,ko00001,ko01000,ko01002,ko04147 Viridiplantae 37S2G@33090,3G8GY@35493,4JHTN@91835,KOG1339@1,KOG1339@2759 NA|NA|NA O Belongs to the peptidase A1 family Pdr17g007420 225117.XP_009377935.1 5e-281 973.0 fabids 2.4.1.324 ko:K21374 ko00000,ko01000,ko01003 GT1 Viridiplantae 37YWK@33090,3GNTU@35493,4JRBN@91835,KOG1192@1,KOG1192@2759 NA|NA|NA CG UDP-Glycosyltransferase Pdr17g007430 225117.XP_009377934.1 3e-206 724.2 fabids 2.4.1.324 ko:K21374 ko00000,ko01000,ko01003 GT1 Viridiplantae 37YWK@33090,3GNTU@35493,4JRBN@91835,KOG1192@1,KOG1192@2759 NA|NA|NA CG UDP-Glycosyltransferase Pdr17g007440 225117.XP_009349615.1 7.2e-208 729.6 fabids 2.4.1.324 ko:K21374 ko00000,ko01000,ko01003 GT1 Viridiplantae 37YWK@33090,3GNTU@35493,4JRBN@91835,KOG1192@1,KOG1192@2759 NA|NA|NA CG UDP-Glycosyltransferase Pdr17g007450 225117.XP_009349616.1 5.5e-283 979.5 fabids 2.4.1.324 ko:K21374 ko00000,ko01000,ko01003 GT1 Viridiplantae 37YWK@33090,3GNTU@35493,4JRBN@91835,KOG1192@1,KOG1192@2759 NA|NA|NA CG UDP-Glycosyltransferase Pdr17g007460 225117.XP_009377939.1 3.5e-178 630.9 fabids GO:0003674,GO:0003824,GO:0003916,GO:0003917,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005654,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006265,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016043,GO:0016604,GO:0016605,GO:0016853,GO:0031974,GO:0031981,GO:0034641,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043233,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044428,GO:0044446,GO:0044451,GO:0044464,GO:0046483,GO:0051276,GO:0070013,GO:0071103,GO:0071704,GO:0071840,GO:0090304,GO:0140097,GO:1901360 ko:K09250 ko00000,ko03000 Viridiplantae 37Q96@33090,3GFNC@35493,4JPDI@91835,COG5082@1,KOG4400@2759 NA|NA|NA O Introduces a single-strand break via transesterification at a target site in duplex DNA. 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The scissile phosphodiester is attacked by the catalytic tyrosine of the enzyme, resulting in the formation of a DNA-(5'-phosphotyrosyl)-enzyme intermediate and the expulsion of a 3'-OH DNA strand Pdr17g007470 90675.XP_010477328.1 5.1e-43 180.6 Streptophyta Viridiplantae 38035@33090,3GPUG@35493,COG2801@1,KOG0017@2759 NA|NA|NA L transposition, RNA-mediated Pdr17g007480 225117.XP_009349618.1 1.8e-286 991.1 fabids 2.4.1.324 ko:K21374 ko00000,ko01000,ko01003 GT1 Viridiplantae 37YWK@33090,3GNTU@35493,4JRBN@91835,KOG1192@1,KOG1192@2759 NA|NA|NA CG UDP-Glycosyltransferase Pdr17g007490 225117.XP_009377947.1 7.3e-280 969.1 fabids 2.4.1.324 ko:K21374 ko00000,ko01000,ko01003 GT1 Viridiplantae 37YWK@33090,3GNTU@35493,4JRBN@91835,KOG1192@1,KOG1192@2759 NA|NA|NA CG UDP-Glycosyltransferase Pdr17g007500 225117.XP_009377949.1 1.5e-280 971.5 fabids 2.4.1.324 ko:K21374 ko00000,ko01000,ko01003 GT1 Viridiplantae 37YWK@33090,3GNTU@35493,4JRBN@91835,KOG1192@1,KOG1192@2759 NA|NA|NA CG UDP-Glycosyltransferase 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The reaction takes place in the presence of glutamine and ATP through an activated gamma-phospho- Glu-tRNA(Gln) Pdr17g008700 225117.XP_009339538.1 1.5e-198 698.7 fabids GO:0003674,GO:0003779,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005737,GO:0005856,GO:0005885,GO:0006996,GO:0007010,GO:0007015,GO:0008064,GO:0008092,GO:0008150,GO:0009987,GO:0010638,GO:0015629,GO:0016043,GO:0030029,GO:0030036,GO:0030832,GO:0030833,GO:0030838,GO:0031334,GO:0032271,GO:0032273,GO:0032535,GO:0032956,GO:0032970,GO:0032991,GO:0033043,GO:0034314,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043232,GO:0043254,GO:0044087,GO:0044089,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044430,GO:0044446,GO:0044464,GO:0044877,GO:0045010,GO:0048518,GO:0048522,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051015,GO:0051128,GO:0051130,GO:0051493,GO:0051495,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071840,GO:0090066,GO:0097435,GO:0110053,GO:1902903,GO:1902905 ko:K05757 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The product decarboxylates to 4-methyl-2 oxopentanoate Pdr17g014720 3760.EMJ12219 2.4e-204 718.4 fabids Viridiplantae 28KK3@1,2QT1I@2759,37NEM@33090,3GBN2@35493,4JCZF@91835 NA|NA|NA S Domain of unknown function (DUF2828) Pdr17g014740 3750.XP_008391117.1 1.4e-292 1011.5 fabids 2.3.2.27 ko:K10632 ko04014,map04014 ko00000,ko00001,ko01000,ko04121 Viridiplantae 37HX1@33090,3G7U7@35493,4JH26@91835,KOG0804@1,KOG0804@2759 NA|NA|NA O Brca1-associated Pdr17g014750 3750.XP_008391118.1 1.2e-226 792.3 fabids 2.3.2.27 ko:K10268,ko:K10632 ko04014,map04014 ko00000,ko00001,ko01000,ko04121 Viridiplantae 37QNQ@33090,3GAMJ@35493,4JF54@91835,KOG1947@1,KOG1947@2759 NA|NA|NA S F-box LRR-repeat protein Pdr17g014760 3750.XP_008365469.1 2.6e-141 508.1 fabids GO:0000160,GO:0003674,GO:0003700,GO:0006355,GO:0007154,GO:0007165,GO:0008150,GO:0009719,GO:0009723,GO:0009725,GO:0009755,GO:0009873,GO:0009889,GO:0009987,GO:0010033,GO:0010468,GO:0010556,GO:0019219,GO:0019222,GO:0023052,GO:0031323,GO:0031326,GO:0032870,GO:0035556,GO:0042221,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051171,GO:0051252,GO:0051716,GO:0060255,GO:0065007,GO:0070887,GO:0071310,GO:0071369,GO:0071495,GO:0080090,GO:0140110,GO:1903506,GO:2000112,GO:2001141 Viridiplantae 2C3FQ@1,2S2TQ@2759,37VDW@33090,3GI25@35493,4JPYA@91835 NA|NA|NA K transcription factor Pdr17g014770 225117.XP_009356989.1 2.8e-09 67.4 fabids Viridiplantae 2AJCP@1,2RZ6T@2759,37UX0@33090,3GIXN@35493,4JPIT@91835 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF1639) Pdr17g014780 3750.XP_008376318.1 2.1e-43 182.2 fabids Viridiplantae 2EPKZ@1,2SSSN@2759,3816G@33090,3GQHN@35493,4JUVA@91835 NA|NA|NA S Myb/SANT-like DNA-binding domain Pdr17g014790 102107.XP_008222479.1 1.9e-192 678.3 fabids GCP2 GO:0000408,GO:0002949,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0032991,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046483,GO:0070525,GO:0071704,GO:0090304,GO:1901360 2.3.1.234 ko:K01409 R10648 RC00070,RC00416 ko00000,ko01000,ko03016 Viridiplantae 37P73@33090,3GBBG@35493,4JGQI@91835,COG0533@1,KOG2708@2759 NA|NA|NA O Component of the EKC KEOPS complex that is required for the formation of a threonylcarbamoyl group on adenosine at position 37 (t(6)A37) in tRNAs that read codons beginning with adenine. The complex is probably involved in the transfer of the threonylcarbamoyl moiety of threonylcarbamoyl-AMP (TC-AMP) to the N6 group of A37. 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Some of these proteins have been shown both in vivo and in vitro to have ubiquitin E3 ligase activity. Pdr3g001720 225117.XP_009349548.1 0.0 1516.5 fabids ko:K15332 ko00000,ko01000,ko03016 Viridiplantae 37HMZ@33090,3GD50@35493,4JJN2@91835,COG2265@1,COG5063@1,KOG1677@2759,KOG2187@2759 NA|NA|NA J Belongs to the class I-like SAM-binding methyltransferase superfamily. 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Adaptor protein complexes function in protein transport via transport vesicles in different membrane traffic pathways. Adaptor protein complexes are vesicle coat components and appear to be involved in cargo selection and vesicle formation. AP-2 is involved in clathrin-dependent endocytosis in which cargo proteins are incorporated into vesicles surrounded by clathrin (clathrin-coated vesicles, CCVs) which are destined for fusion with the early endosome Pdr3g002940 225117.XP_009364841.1 0.0 3175.2 fabids 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Required for establishment of the Casparian strip membrane domain (CSD) and the subsequent formation of Casparian strips, a cell wall modification of the root endodermis that determines an apoplastic barrier between the intraorganismal apoplasm and the extraorganismal apoplasm and prevents lateral diffusion (By similarity) Pdr3g005090 3750.XP_008372744.1 4.2e-252 877.1 fabids 3.4.19.12 ko:K12655 ko04622,map04622 ko00000,ko00001,ko01000,ko01002,ko04121 Viridiplantae 37PX7@33090,3GGD9@35493,4JNJB@91835,KOG2605@1,KOG2605@2759 NA|NA|NA OT OTU domain-containing protein Pdr3g005100 225117.XP_009377814.1 1.9e-187 661.8 fabids 3.4.19.12 ko:K12655 ko04622,map04622 ko00000,ko00001,ko01000,ko01002,ko04121 Viridiplantae 37PX7@33090,3GGD9@35493,4JNJB@91835,KOG2605@1,KOG2605@2759,KOG2868@1,KOG2868@2759 NA|NA|NA OT OTU domain-containing protein Pdr3g005110 3750.XP_008361046.1 7.7e-25 119.8 fabids ko:K13195 ko00000,ko03041 Viridiplantae 37VJG@33090,3GM91@35493,4JR4A@91835,KOG0118@1,KOG0118@2759 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Also essential during biosynthesis of the molybdenum cofactor. Acts by mediating the C-terminal thiocarboxylation of sulfur carriers URM1 and MOCS2A. Its N-terminus first activates URM1 and MOCS2A as acyl-adenylates (-COAMP), then the persulfide sulfur on the catalytic cysteine is transferred to URM1 and MOCS2A to form thiocarboxylation (-COSH) of their C-terminus. The reaction probably involves hydrogen sulfide that is generated from the persulfide intermediate and that acts as nucleophile towards URM1 and MOCS2A. Subsequently, a transient disulfide bond is formed. Does not use thiosulfate as sulfur donor Pdr3g009810 225117.XP_009336947.1 8.2e-36 156.0 fabids GO:0003674,GO:0005488,GO:0005506,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005739,GO:0005759,GO:0006790,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008198,GO:0009507,GO:0009526,GO:0009536,GO:0009941,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016043,GO:0016226,GO:0019538,GO:0022607,GO:0031163,GO:0031967,GO:0031974,GO:0031975,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043233,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044429,GO:0044434,GO:0044435,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044464,GO:0046872,GO:0046914,GO:0048037,GO:0051186,GO:0051536,GO:0051537,GO:0051540,GO:0051604,GO:0070013,GO:0071704,GO:0071840,GO:0097428,GO:1901564 Viridiplantae 37N10@33090,3GD8F@35493,4JNIS@91835,COG0316@1,KOG1119@2759 NA|NA|NA CU protein At5g03900, chloroplastic-like Pdr3g009820 57918.XP_004300827.1 8.2e-21 106.3 Streptophyta Viridiplantae 2EHNT@1,2SN9T@2759,37ZIG@33090,3GPPV@35493 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splice-site and the subsequent assembly of the spliceosome. U1-C is directly involved in initial 5' splice-site recognition for both constitutive and regulated alternative splicing. The interaction with the 5' splice-site seems to precede base-pairing between the pre-mRNA and the U1 snRNA. 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(AuxREs) Pdr3g015760 3750.XP_008355480.1 2.8e-34 152.5 Streptophyta ko:K14486 ko04075,map04075 ko00000,ko00001 Viridiplantae 28JYJ@1,2RG5M@2759,37RA8@33090,3G9F2@35493 NA|NA|NA K Auxin response factors (ARFs) are transcriptional factors that bind specifically to the DNA sequence 5'-TGTCTC-3' found in the auxin-responsive promoter elements (AuxREs) Pdr3g015770 3750.XP_008368916.1 0.0 1093.2 fabids Viridiplantae 37N5Z@33090,3G96D@35493,4JK1I@91835,COG0265@1,KOG1320@2759 NA|NA|NA O Protease Do-like 2 Pdr3g015780 3750.XP_008368915.1 3.3e-35 154.1 fabids 1.14.13.168 ko:K11816 ko00380,ko01100,map00380,map01100 R10181 RC00866 ko00000,ko00001,ko01000 Viridiplantae 37HT1@33090,3G8FC@35493,4JI6D@91835,COG2072@1,KOG1399@2759 NA|NA|NA Q monooxygenase Pdr3g015790 3750.XP_008368917.1 2.8e-205 721.1 fabids 1.14.13.168 ko:K11816 ko00380,ko01100,map00380,map01100 R10181 RC00866 ko00000,ko00001,ko01000 Viridiplantae 37HT1@33090,3G8FC@35493,4JI6D@91835,COG2072@1,KOG1399@2759 NA|NA|NA Q monooxygenase 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Mediator complex, a coactivator involved in regulated transcription of nearly all RNA polymerase II-dependent genes. Mediator functions as a bridge to convey information from gene-specific regulatory proteins to the basal RNA polymerase II transcription machinery. Mediator is recruited to promoters by direct interactions with regulatory proteins and serves as a scaffold for the assembly of a functional preinitiation complex with RNA polymerase II and the general transcription factors Pdr3g017610 3750.XP_008352007.1 2.9e-130 471.5 fabids Viridiplantae 2QS68@2759,37QV9@33090,3GE59@35493,4JP7R@91835,COG0231@1 NA|NA|NA J Elongation factor Pdr3g017620 3750.XP_008351464.1 7.3e-169 599.7 fabids GO:0003674,GO:0005215,GO:0005310,GO:0005342,GO:0005575,GO:0005618,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005739,GO:0005740,GO:0005743,GO:0005773,GO:0005774,GO:0005911,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006820,GO:0006835,GO:0006839,GO:0006842,GO:0008150,GO:0008509,GO:0008514,GO:0009506,GO:0009507,GO:0009526,GO:0009536,GO:0009941,GO:0015075,GO:0015140,GO:0015142,GO:0015291,GO:0015297,GO:0015301,GO:0015318,GO:0015367,GO:0015556,GO:0015711,GO:0015740,GO:0015742,GO:0015743,GO:0015849,GO:0016020,GO:0016021,GO:0019866,GO:0022804,GO:0022857,GO:0030054,GO:0030312,GO:0031090,GO:0031224,GO:0031966,GO:0031967,GO:0031975,GO:0034220,GO:0035674,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044429,GO:0044434,GO:0044435,GO:0044437,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044464,GO:0046942,GO:0046943,GO:0051179,GO:0051181,GO:0051234,GO:0055044,GO:0055085,GO:0071423,GO:0071702,GO:0071944,GO:0098588,GO:0098656,GO:0098805,GO:0099516,GO:1903825,GO:1905039 ko:K15104 ko00000,ko02000 2.A.29.2.1,2.A.29.2.9 Viridiplantae 37NII@33090,3G7AV@35493,4JKDX@91835,KOG0759@1,KOG0759@2759 NA|NA|NA C Belongs to the mitochondrial carrier (TC 2.A.29) family Pdr3g017630 225117.XP_009375870.1 2.9e-262 910.6 fabids TUA3 GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005856,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0044424,GO:0044464 ko:K07374 ko04145,ko04210,ko04530,ko04540,ko05130,map04145,map04210,map04530,map04540,map05130 ko00000,ko00001,ko03019,ko03036,ko04147,ko04812 Viridiplantae 37NA5@33090,3G7Z6@35493,4JEUX@91835,COG5023@1,KOG1376@2759 NA|NA|NA Z Tubulin is the major constituent of microtubules. 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NA|NA|NA O ATP-dependent serine protease that mediates the selective degradation of misfolded, unassembled or oxidatively damaged polypeptides as well as certain short-lived regulatory proteins in the mitochondrial matrix. May also have a chaperone function in the assembly of inner membrane protein complexes. Participates in the regulation of mitochondrial gene expression and in the maintenance of the integrity of the mitochondrial genome. 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37HZX@33090,3GABD@35493,4JM2D@91835,COG5147@1,KOG0048@2759 NA|NA|NA ADK RNA polymerase II transcription regulator recruiting activity Pdr4g004760 29760.VIT_07s0005g02440.t01 2.1e-242 845.5 Streptophyta 3.1.1.98 ko:K19882 ko04310,map04310 R11202 RC00020,RC00041 ko00000,ko00001,ko01000 Viridiplantae 37RWV@33090,3G7UB@35493,KOG4287@1,KOG4287@2759 NA|NA|NA M Hydrolyzes acetyl esters in homogalacturonan regions of pectin. In type I primary cell wall, galacturonic acid residues of pectin can be acetylated at the O-2 and O-3 positions. Decreasing the degree of acetylation of pectin gels in vitro alters their physical properties Pdr4g004770 225117.XP_009366012.1 2.6e-241 840.9 fabids GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005618,GO:0005623,GO:0008150,GO:0009505,GO:0009987,GO:0016043,GO:0016787,GO:0016788,GO:0030312,GO:0044464,GO:0045229,GO:0052689,GO:0052793,GO:0071554,GO:0071555,GO:0071840,GO:0071944 3.1.1.98 ko:K19882 ko04310,map04310 R11202 RC00020,RC00041 ko00000,ko00001,ko01000 Viridiplantae 37RWV@33090,3G7UB@35493,4JEA8@91835,KOG4287@1,KOG4287@2759 NA|NA|NA M Hydrolyzes acetyl esters in homogalacturonan regions of pectin. In type I primary cell wall, galacturonic acid residues of pectin can be acetylated at the O-2 and O-3 positions. Decreasing the degree of acetylation of pectin gels in vitro alters their physical properties Pdr4g004780 225117.XP_009366004.1 1.4e-309 1068.1 fabids ko:K14638 ko00000,ko02000 2.A.17.3 Viridiplantae 37Q3F@33090,3GAUR@35493,4JHK0@91835,COG3104@1,KOG1237@2759 NA|NA|NA E Protein NRT1 PTR FAMILY 4.5-like Pdr4g004790 225117.XP_009366005.1 0.0 1089.7 fabids ko:K14638 ko00000,ko02000 2.A.17.3 Viridiplantae 37Q3F@33090,3GAUR@35493,4JHK0@91835,COG3104@1,KOG1237@2759 NA|NA|NA E Protein NRT1 PTR FAMILY 4.5-like Pdr4g004800 225117.XP_009366006.1 1e-237 828.9 fabids FEN1 GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005730,GO:0031974,GO:0031981,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043232,GO:0043233,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044428,GO:0044446,GO:0044464,GO:0070013 ko:K04799 ko03030,ko03410,ko03450,map03030,map03410,map03450 ko00000,ko00001,ko01000,ko03032,ko03400,ko04147 Viridiplantae 37MC4@33090,3G9DG@35493,4JDRI@91835,COG0258@1,KOG2519@2759 NA|NA|NA L Structure-specific nuclease with 5'-flap endonuclease and 5'-3' exonuclease activities involved in DNA replication and repair. During DNA replication, cleaves the 5'-overhanging flap structure that is generated by displacement synthesis when DNA polymerase encounters the 5'-end of a downstream Okazaki fragment. It enters the flap from the 5'-end and then tracks to cleave the flap base, leaving a nick for ligation. Also involved in the long patch base excision repair (LP-BER) pathway, by cleaving within the apurinic apyrimidinic (AP) site-terminated flap. Acts as a genome stabilization factor that prevents flaps from equilibrating into structurs that lead to duplications and deletions. Also possesses 5'-3' exonuclease activity on nicked or gapped double- stranded DNA, and exhibits RNase H activity. 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May play a role in wax or cutin deposition in the cell walls of expanding epidermal cells and certain secretory tissues Pdr4g005760 225117.XP_009346912.1 1.2e-55 222.2 fabids Viridiplantae 2CTTZ@1,2S4CI@2759,37VZU@33090,3GK7B@35493,4JUHG@91835 NA|NA|NA T Plant non-specific lipid-transfer proteins transfer phospholipids as well as galactolipids across membranes. May play a role in wax or cutin deposition in the cell walls of expanding epidermal cells and certain secretory tissues Pdr4g005770 225117.XP_009346913.1 3.4e-151 540.8 Streptophyta EXPA8 GO:0005575,GO:0005618,GO:0005623,GO:0006949,GO:0008150,GO:0009653,GO:0009987,GO:0016020,GO:0030312,GO:0032502,GO:0044464,GO:0048646,GO:0048856,GO:0071944 ko:K20628 ko00000 Viridiplantae 28JEF@1,2QPUJ@2759,37QDG@33090,3G7UW@35493 NA|NA|NA S Belongs to the expansin family Pdr4g005780 225117.XP_009346914.1 0.0 1114.8 fabids Viridiplantae 2CMU9@1,2QRZ9@2759,37KU1@33090,3GP11@35493,4JVMU@91835 NA|NA|NA S MAC/Perforin domain Pdr4g005790 225117.XP_009346915.1 5.2e-209 733.4 fabids 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Some of these proteins have been shown both in vivo and in vitro to have ubiquitin E3 ligase activity. 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In type I primary cell wall, galacturonic acid residues of pectin can be acetylated at the O-2 and O-3 positions. Decreasing the degree of acetylation of pectin gels in vitro alters their physical properties Pdr4g009030 3750.XP_008369893.1 4.5e-238 830.1 fabids GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005618,GO:0005623,GO:0008150,GO:0009505,GO:0009987,GO:0016043,GO:0016787,GO:0016788,GO:0030312,GO:0044464,GO:0045229,GO:0052689,GO:0052793,GO:0071554,GO:0071555,GO:0071840,GO:0071944 3.1.1.98 ko:K19882 ko04310,map04310 R11202 RC00020,RC00041 ko00000,ko00001,ko01000 Viridiplantae 37PKA@33090,3GF5Z@35493,4JEMY@91835,KOG4287@1,KOG4287@2759 NA|NA|NA M Hydrolyzes acetyl esters in homogalacturonan regions of pectin. In type I primary cell wall, galacturonic acid residues of pectin can be acetylated at the O-2 and O-3 positions. Decreasing the degree of acetylation of pectin gels in vitro alters their physical properties Pdr4g009040 3750.XP_008363856.1 1.2e-267 928.7 fabids GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005783,GO:0005789,GO:0006464,GO:0006486,GO:0006487,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006970,GO:0007275,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009100,GO:0009101,GO:0009628,GO:0009651,GO:0009987,GO:0012505,GO:0016020,GO:0016740,GO:0016757,GO:0016758,GO:0019538,GO:0031984,GO:0032501,GO:0032502,GO:0034645,GO:0036211,GO:0042175,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043412,GO:0043413,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044432,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044464,GO:0046527,GO:0048366,GO:0048367,GO:0048731,GO:0048827,GO:0048856,GO:0050896,GO:0070085,GO:0071704,GO:0098827,GO:0099402,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.4.1.256 ko:K03850 ko00510,ko01100,map00510,map01100 M00055 R06264 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of cellular and viral proteins. Some of these proteins have been shown both in vivo and in vitro to have ubiquitin E3 ligase activity. 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electrons from H(2)O, generating O(2) and a proton gradient subsequently used for ATP formation. It consists of a core antenna complex that captures photons, and an electron transfer chain that converts photonic excitation into a charge separation. The D1 D2 (PsbA PsbA) reaction center heterodimer binds P680, the primary electron donor of PSII as well as several subsequent electron acceptors. D2 is needed for assembly of a stable PSII complex Pdr4g011360 225117.XP_009334653.1 0.0 1511.9 fabids GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005730,GO:0005737,GO:0005794,GO:0005829,GO:0005886,GO:0008150,GO:0009893,GO:0009894,GO:0009896,GO:0010035,GO:0010038,GO:0010604,GO:0012505,GO:0016020,GO:0019222,GO:0031974,GO:0031981,GO:0042176,GO:0042221,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043232,GO:0043233,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044428,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044464,GO:0045732,GO:0046686,GO:0048518,GO:0050789,GO:0050896,GO:0051171,GO:0051173,GO:0051246,GO:0051247,GO:0060255,GO:0065007,GO:0070013,GO:0071944,GO:0080090 ko:K13525 ko04141,ko05134,map04141,map05134 M00400,M00403 ko00000,ko00001,ko00002,ko03019,ko04131,ko04147 3.A.16.1 Viridiplantae 37KI9@33090,3G7QA@35493,4JIF5@91835,COG0464@1,KOG0730@2759 NA|NA|NA O Cell division Pdr4g011370 102107.XP_008243986.1 6.7e-273 946.4 fabids 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Serves as sulfur donor in tRNA 2- thiolation reaction by being thiocarboxylated (-COSH) at its C- terminus by MOCS3. The sulfur is then transferred to tRNA to form 2-thiolation of mcm(5)S(2)U. Also acts as a ubiquitin-like protein (UBL) that is covalently conjugated via an isopeptide bond to lysine residues of target proteins. The thiocarboxylated form serves as substrate for conjugation and oxidative stress specifically induces the formation of UBL-protein conjugates Pdr4g016280 225117.XP_009341152.1 0.0 1359.4 fabids GO:0003674,GO:0005096,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006810,GO:0006886,GO:0008047,GO:0008104,GO:0008150,GO:0012505,GO:0012506,GO:0015031,GO:0015833,GO:0016020,GO:0017016,GO:0017137,GO:0019899,GO:0030234,GO:0030659,GO:0030695,GO:0031090,GO:0031267,GO:0031338,GO:0031410,GO:0031982,GO:0032879,GO:0033036,GO:0033043,GO:0034613,GO:0042886,GO:0043085,GO:0043087,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043547,GO:0044093,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044433,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044464,GO:0045184,GO:0046907,GO:0050789,GO:0050790,GO:0050794,GO:0051020,GO:0051049,GO:0051128,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051336,GO:0051345,GO:0051641,GO:0051649,GO:0060589,GO:0060627,GO:0065007,GO:0065009,GO:0070727,GO:0071702,GO:0071705,GO:0090630,GO:0097708,GO:0098772 ko:K21847 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pathogen attack and oxidative stress Pdr4g016300 225117.XP_009341156.1 8.4e-131 473.0 fabids Viridiplantae 28JZ2@1,2QSDG@2759,37QGX@33090,3G9EJ@35493,4JD01@91835 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF3755) Pdr4g016310 225117.XP_009341157.1 1.6e-270 938.3 fabids Viridiplantae 28PAN@1,2QVXZ@2759,37MA6@33090,3GAWM@35493,4JNJR@91835 NA|NA|NA Pdr4g016320 225117.XP_009341158.1 2.1e-224 784.6 fabids Viridiplantae 2QW79@2759,37NC4@33090,3GDWG@35493,4JI7W@91835,COG4043@1 NA|NA|NA S isoform X1 Pdr4g016330 225117.XP_009341163.1 2.2e-265 921.0 fabids Viridiplantae 28K9J@1,2QQN4@2759,37J7P@33090,3GASA@35493,4JIJ6@91835 NA|NA|NA K Belongs to the GRAS family Pdr4g016340 225117.XP_009341164.1 2e-30 138.3 Streptophyta ko:K02923 ko03010,map03010 M00177 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Viridiplantae 37VZR@33090,3GK1H@35493,KOG3499@1,KOG3499@2759 NA|NA|NA J Belongs to the eukaryotic ribosomal protein eL38 family Pdr4g016350 225117.XP_009341165.1 1.9e-198 698.4 fabids 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S acid phosphatase activity Pdr4g016380 3750.XP_008369178.1 0.0 1349.7 fabids Viridiplantae 28NJ9@1,2QV4V@2759,37HRW@33090,3G93I@35493,4JJZ1@91835 NA|NA|NA S Plant protein of unknown function (DUF936) Pdr4g016390 225117.XP_009341167.1 2.5e-186 658.3 fabids 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Calreticulin family Pdr4g016400 225117.XP_009341168.1 1.4e-192 678.7 fabids GLX2-1 GO:0001101,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004416,GO:0005488,GO:0005506,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005739,GO:0006950,GO:0006970,GO:0008150,GO:0008270,GO:0008800,GO:0009507,GO:0009536,GO:0009628,GO:0009651,GO:0010033,GO:0010243,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016790,GO:0016810,GO:0016812,GO:0034059,GO:0036293,GO:0042221,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043200,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046872,GO:0046914,GO:0050896,GO:0070482,GO:1901698,GO:1901700 3.1.2.6 ko:K01069 ko00620,map00620 R01736 RC00004,RC00137 ko00000,ko00001,ko01000 Viridiplantae 37IUX@33090,3G9IN@35493,4JEVR@91835,COG0491@1,KOG0813@2759 NA|NA|NA S hydroxyacylglutathione hydrolase 2 Pdr4g016410 225117.XP_009341169.1 0.0 1153.3 fabids GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005911,GO:0009506,GO:0016020,GO:0030054,GO:0044464,GO:0055044,GO:0071944 1.1.1.170 ko:K07748 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The DNA N-glycosylase activity releases the damaged DNA base from DNA by cleaving the N- glycosidic bond, leaving an AP site. The AP lyase activity cleaves the phosphodiester bond 3' to the AP site by a beta-elimination. 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Releases the supercoiling and torsional tension of DNA introduced during the DNA replication and transcription by transiently cleaving and rejoining one strand of the DNA duplex. The scissile phosphodiester is attacked by the catalytic tyrosine of the enzyme, resulting in the formation of a DNA-(5'-phosphotyrosyl)-enzyme intermediate and the expulsion of a 3'-OH DNA strand Pdr4g018350 3750.XP_008344165.1 1.6e-87 329.3 Streptophyta Viridiplantae 2CXJQ@1,2RY1G@2759,37UAJ@33090,3GIFY@35493 NA|NA|NA S gag-polypeptide of LTR copia-type Pdr4g018360 225117.XP_009371096.1 2e-248 865.1 fabids Viridiplantae 2CCVI@1,2QRSF@2759,37R7T@33090,3G9HJ@35493,4JCYX@91835 NA|NA|NA K transcription factor Pdr4g018370 3750.XP_008337488.1 0.0 2068.1 fabids KIN12B GO:0000003,GO:0000226,GO:0000280,GO:0000910,GO:0003674,GO:0003774,GO:0003777,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005856,GO:0005871,GO:0005875,GO:0006928,GO:0006996,GO:0007010,GO:0007017,GO:0007018,GO:0007049,GO:0007112,GO:0007140,GO:0007275,GO:0007276,GO:0008150,GO:0008574,GO:0009524,GO:0009555,GO:0009987,GO:0015630,GO:0016043,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0019953,GO:0022402,GO:0022412,GO:0022414,GO:0032501,GO:0032502,GO:0032504,GO:0032991,GO:0033206,GO:0042623,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044430,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044464,GO:0044703,GO:0048229,GO:0048232,GO:0048285,GO:0048609,GO:0048856,GO:0051301,GO:0051321,GO:0051704,GO:0055046,GO:0061640,GO:0071840,GO:0080175,GO:0140013,GO:1903046,GO:1990939 ko:K10400 ko00000,ko04812 Viridiplantae 37RUZ@33090,3G9S6@35493,4JHII@91835,COG5059@1,KOG4280@2759 NA|NA|NA Z Belongs to the TRAFAC class myosin-kinesin ATPase superfamily. 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ko00520,map00520 R09009 RC02396 ko00000,ko00001,ko01000,ko01003 GT75 Viridiplantae 2QSDP@2759,37P8P@33090,3GAX4@35493,arCOG06245@1 NA|NA|NA S UDP-arabinopyranose mutase activity Pdr4g018690 225117.XP_009347002.1 0.0 1250.7 fabids Viridiplantae 28XIB@1,2R4BG@2759,37T5Z@33090,3GHA6@35493,4JRR9@91835 NA|NA|NA T TMV resistance protein N-like Pdr4g018700 3750.XP_008384424.1 8.8e-11 73.6 fabids ko:K14317 ko03013,ko05169,map03013,map05169 M00427 ko00000,ko00001,ko00002,ko03019 1.I.1 Viridiplantae 2CMXB@1,2QSI5@2759,37ICG@33090,3GAQV@35493,4JISX@91835 NA|NA|NA S Nuclear pore complex protein Pdr4g018710 225117.XP_009347004.1 1.7e-96 360.1 fabids ko:K17964 ko00000,ko03029 Viridiplantae 37RH1@33090,3GGGX@35493,4JHYJ@91835,KOG4197@1,KOG4197@2759 NA|NA|NA AT Pentatricopeptide repeat-containing protein Pdr4g018720 225117.XP_009347002.1 0.0 1172.5 fabids Viridiplantae 28XIB@1,2R4BG@2759,37T5Z@33090,3GHA6@35493,4JRR9@91835 NA|NA|NA T TMV resistance protein N-like Pdr4g018730 3750.XP_008380491.1 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Pentatricopeptide repeat domain Pdr4g018770 3750.XP_008380510.1 2.5e-124 451.4 Streptophyta 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light-harvesting complex (LHC) functions as a light receptor, it captures and delivers excitation energy to photosystems with which it is closely associated Pdr5g000440 225117.XP_009334054.1 3.6e-45 189.1 Eukaryota Eukaryota 2D6NP@1,2T2GB@2759 NA|NA|NA Pdr5g000450 3750.XP_008355389.1 2.5e-22 112.1 Eukaryota Eukaryota KOG1075@1,KOG1075@2759 NA|NA|NA E Ribonuclease H protein Pdr5g000460 225117.XP_009366887.1 4.3e-134 484.2 fabids 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After interaction with MOCS2B, the sulfur is then transferred to precursor Z to form molybdopterin Pdr5g000750 225117.XP_009366851.1 1.4e-111 409.1 fabids GO:0003674,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006873,GO:0006875,GO:0008150,GO:0009987,GO:0019725,GO:0030001,GO:0030003,GO:0042592,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046872,GO:0046914,GO:0046916,GO:0048878,GO:0050801,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055065,GO:0055076,GO:0055080,GO:0055082,GO:0065007,GO:0065008,GO:0098771 Viridiplantae 37UUD@33090,3GIUG@35493,4JPSR@91835,KOG1603@1,KOG1603@2759 NA|NA|NA P Heavy-metal-associated domain Pdr5g000760 225117.XP_009366852.1 3.4e-170 604.4 fabids Viridiplantae 28IR2@1,2QR2C@2759,37INW@33090,3GFUT@35493,4JK5Q@91835 NA|NA|NA Pdr5g000770 225117.XP_009366845.1 0.0 1651.0 fabids 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Transfers a dCMP residue from dCTP to the 3'-end of a DNA primer in a template-dependent reaction. May assist in the first step in the bypass of abasic lesions by the insertion of a nucleotide opposite the lesion. 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Can also transport other divalent cations such as Fe(2 ), Sr(2 ), Ba(2 ), Mn(2 ) and Co(2 ) but to a much less extent than Mg(2 ) Pdr5g011920 225117.XP_009346638.1 7.6e-154 550.1 fabids Viridiplantae 2C1KS@1,2QWKA@2759,37IPB@33090,3GAJZ@35493,4JE4B@91835 NA|NA|NA S Pollen proteins Ole e I like Pdr5g011930 225117.XP_009377669.1 6e-179 633.6 fabids 3.5.1.4 ko:K01426 ko00330,ko00360,ko00380,ko00627,ko00643,ko01120,map00330,map00360,map00380,map00627,map00643,map01120 R02540,R03096,R03180,R03909,R05551,R05590 RC00010,RC00100,RC00950,RC01025 ko00000,ko00001,ko01000 Viridiplantae 37JFQ@33090,3GBRU@35493,4JESB@91835,COG0154@1,KOG1211@2759 NA|NA|NA J Amidase Pdr5g011940 3750.XP_008372885.1 1.6e-272 944.9 fabids GO:0003674,GO:0003824,GO:0016787,GO:0016810,GO:0016811 3.5.1.4 ko:K01426 ko00330,ko00360,ko00380,ko00627,ko00643,ko01120,map00330,map00360,map00380,map00627,map00643,map01120 R02540,R03096,R03180,R03909,R05551,R05590 RC00010,RC00100,RC00950,RC01025 ko00000,ko00001,ko01000 Viridiplantae 37JFQ@33090,3GBRU@35493,4JESB@91835,COG0154@1,KOG1211@2759 NA|NA|NA J Amidase Pdr5g011950 3750.XP_008372887.1 6.9e-96 356.7 fabids Viridiplantae 29XXM@1,2RY4Y@2759,37TUX@33090,3GIDX@35493,4JP2G@91835 NA|NA|NA S Dirigent proteins impart stereoselectivity on the phenoxy radical-coupling reaction, yielding optically active lignans from two molecules of coniferyl alcohol in the biosynthesis of lignans, flavonolignans, and alkaloids and thus plays a central role in plant secondary metabolism Pdr5g011960 225117.XP_009346642.1 3.9e-99 367.5 fabids Viridiplantae 29XXM@1,2RXRA@2759,37UDW@33090,3GIEE@35493,4JP4T@91835 NA|NA|NA S Dirigent proteins impart stereoselectivity on the phenoxy radical-coupling reaction, yielding optically active lignans from two molecules of coniferyl alcohol in the biosynthesis of lignans, flavonolignans, and alkaloids and thus plays a central role in plant secondary metabolism Pdr5g011970 225117.XP_009346643.1 3.3e-98 364.4 fabids Viridiplantae 29XXM@1,2RY4Y@2759,37TUX@33090,3GIDX@35493,4JP2G@91835 NA|NA|NA S Dirigent proteins impart stereoselectivity on the phenoxy radical-coupling reaction, yielding optically active lignans from two molecules of coniferyl alcohol in the biosynthesis of lignans, flavonolignans, and alkaloids and thus plays a central role in plant secondary metabolism Pdr5g011990 225117.XP_009340248.1 1.1e-90 339.3 Streptophyta Viridiplantae 29XXM@1,2RY4Y@2759,37TUX@33090,3GIPR@35493 NA|NA|NA S Dirigent proteins impart stereoselectivity on the phenoxy radical-coupling reaction, yielding optically active lignans from two molecules of coniferyl alcohol in the biosynthesis of lignans, flavonolignans, and alkaloids and thus plays a central role in plant secondary metabolism Pdr5g012000 225117.XP_009340247.1 0.0 2200.6 fabids TOC86 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Arabidopsis thaliana protein match is Arabidopsis protein of Pdr5g013700 3750.XP_008382471.1 4.9e-132 477.2 fabids Viridiplantae 28NCI@1,2QUY1@2759,37QEN@33090,3GFDN@35493,4JSHX@91835 NA|NA|NA S Arabidopsis protein of unknown function Pdr5g013710 225117.XP_009346162.1 8.3e-29 133.3 Eukaryota Eukaryota KOG1075@1,KOG1075@2759 NA|NA|NA E Ribonuclease H protein Pdr5g013720 3750.XP_008382492.1 2.1e-86 325.1 fabids Viridiplantae 28NCI@1,2QUY1@2759,37QEN@33090,3GJ7N@35493,4JS3Q@91835 NA|NA|NA S Arabidopsis protein of unknown function Pdr5g013730 3760.EMJ02828 1.4e-07 62.4 Viridiplantae Viridiplantae 28NCI@1,2QUY1@2759,37QEN@33090 NA|NA|NA S BEST Arabidopsis thaliana protein match is Arabidopsis protein of Pdr5g013740 3750.XP_008382472.1 2e-133 481.9 Streptophyta Viridiplantae 28NCI@1,2QUY1@2759,37QEN@33090,3GFDN@35493 NA|NA|NA S BEST Arabidopsis thaliana protein match is Arabidopsis protein of Pdr5g013750 225117.XP_009341561.1 8.9e-11 72.4 Streptophyta Viridiplantae 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The coatomer complex is required for budding from Golgi membranes, and is essential for the retrograde Golgi-to-ER transport of dilysine-tagged proteins Pdr5g021480 57918.XP_004290543.1 3.2e-10 70.9 fabids GO:0003674,GO:0003824,GO:0004672,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006464,GO:0006468,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0007154,GO:0007165,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0019538,GO:0023052,GO:0035556,GO:0036211,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044424,GO:0044464,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051716,GO:0065007,GO:0071704,GO:0140096,GO:1901564 2.7.11.1 ko:K17535 ko00000,ko01000,ko01001 Viridiplantae 37QCR@33090,3G8EZ@35493,4JNHT@91835,COG0515@1,KOG0192@2759 NA|NA|NA T Serine threonine-protein kinase Pdr5g021490 225117.XP_009362164.1 3.6e-91 342.0 fabids 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biosynthetic protein transport from the ER, via the Golgi up to the trans Golgi network Pdr5g021630 225117.XP_009362209.1 3.1e-269 934.1 fabids HDH GO:0000105,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004399,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006547,GO:0006725,GO:0006807,GO:0007275,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009314,GO:0009411,GO:0009416,GO:0009507,GO:0009532,GO:0009536,GO:0009555,GO:0009570,GO:0009628,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016491,GO:0016614,GO:0016616,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019752,GO:0032501,GO:0032502,GO:0034641,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044434,GO:0044435,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046483,GO:0048229,GO:0048856,GO:0050896,GO:0052803,GO:0055114,GO:0071704,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 1.1.1.23 ko:K00013 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Some of these proteins have been shown both in vivo and in vitro to have ubiquitin E3 ligase activity. 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In type I primary cell wall, galacturonic acid residues of pectin can be acetylated at the O-2 and O-3 positions. Decreasing the degree of acetylation of pectin gels in vitro alters their physical properties Pdr6g001150 3847.GLYMA18G49330.2 7.1e-15 86.3 Eukaryota SEC61B 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stimulates binding of mRNA and methionyl-tRNAi to the 40S ribosome. The eIF-3 complex specifically targets and initiates translation of a subset of mRNAs involved in cell proliferation Pdr6g002310 225117.XP_009373466.1 6.8e-163 580.1 fabids GPAT GO:0003674,GO:0003824,GO:0004366,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006629,GO:0006644,GO:0006650,GO:0006655,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008374,GO:0008610,GO:0008654,GO:0009058,GO:0009507,GO:0009532,GO:0009536,GO:0009570,GO:0009987,GO:0016740,GO:0016746,GO:0016747,GO:0019637,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044434,GO:0044435,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044464,GO:0045017,GO:0046471,GO:0046474,GO:0046486,GO:0071704,GO:0090407,GO:1901576 2.3.1.15 ko:K00630 ko00561,ko00564,ko01100,ko01110,map00561,map00564,map01100,map01110 M00089 R00851,R09380 RC00004,RC00039,RC00041 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01004 iRC1080.CRv4_Au5_s2_g9657_t1 Viridiplantae 28J58@1,2QRHE@2759,37IRW@33090,3GAB9@35493,4JI9Q@91835 NA|NA|NA I Esterifies acyl-group from acyl-ACP to the sn-1 position of glycerol-3-phosphate. The enzyme from chilling-resistant plants discriminates against non-fluid palmitic acid and selects oleic acid whereas the enzyme from sensitive plants accepts both fatty acids Pdr6g002320 102107.XP_008226108.1 9.1e-25 119.4 fabids Viridiplantae 28SB7@1,2QZ0Q@2759,37I9D@33090,3GCM7@35493,4JHT6@91835 NA|NA|NA Pdr6g002330 225117.XP_009373463.1 2.7e-166 591.7 fabids GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003700,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0006355,GO:0008150,GO:0009889,GO:0009891,GO:0009893,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010604,GO:0010628,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031328,GO:0042802,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043565,GO:0044424,GO:0044464,GO:0045893,GO:0045935,GO:0048518,GO:0048522,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051173,GO:0051252,GO:0051254,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:0097159,GO:0140110,GO:1901363,GO:1902680,GO:1903506,GO:1903508,GO:2000112,GO:2001141 ko:K09060 ko00000,ko03000 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COG3491@1,KOG0143@2759 NA|NA|NA C Belongs to the iron ascorbate-dependent oxidoreductase family Pdr6g002400 225117.XP_009373456.1 5.6e-217 760.0 fabids 2.7.6.1 ko:K00948 ko00030,ko00230,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko01230,map00030,map00230,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map01230 M00005 R01049 RC00002,RC00078 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iRC1080.CRv4_Au5_s8_g15040_t1 Viridiplantae 37RIN@33090,3GEMM@35493,4JDAH@91835,COG0462@1,KOG1448@2759 NA|NA|NA EF Ribose-phosphate pyrophosphokinase Pdr6g002410 225117.XP_009373455.1 0.0 1239.6 fabids ALS2 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Necessary for type 2 peroxisome targeting signal (PTS2)-containing protein processing and facilitates peroxisome matrix protein import Pdr6g003840 225117.XP_009371861.1 7.6e-211 739.6 fabids Viridiplantae 28N5V@1,2QUR3@2759,37KWF@33090,3GDSD@35493,4JF91@91835 NA|NA|NA Pdr6g003850 225117.XP_009333977.1 9.1e-25 121.3 Streptophyta ko:K05391 ko04626,map04626 ko00000,ko00001,ko04040 1.A.1.5 Viridiplantae 37Q35@33090,3GAHY@35493,KOG0498@1,KOG0498@2759 NA|NA|NA PT Cyclic nucleotide-gated ion channel 1-like Pdr6g003860 3750.XP_008371692.1 2.8e-22 112.5 fabids Viridiplantae 37R6P@33090,3G8BW@35493,4JN0G@91835,COG2801@1,KOG0017@2759 NA|NA|NA L Uncharacterized protein K02A2.6-like Pdr6g003870 225117.XP_009371860.1 1.8e-131 475.7 fabids 2.3.2.27 ko:K19042 ko00000,ko01000,ko04121 Viridiplantae 37SJI@33090,3GH44@35493,4JN96@91835,KOG1100@1,KOG1100@2759 NA|NA|NA O E3 ubiquitin-protein ligase Pdr6g003900 3750.XP_008373624.1 9.2e-92 342.8 fabids Viridiplantae 2AMXX@1,2RZD3@2759,37UYB@33090,3GJ02@35493,4JTZ8@91835 NA|NA|NA S zinc-finger of the FCS-type, C2-C2 Pdr6g003910 225117.XP_009371859.1 0.0 6429.4 fabids ko:K19525 ko00000 Viridiplantae 37IJB@33090,3G9S2@35493,4JKXS@91835,COG5043@1,KOG1809@2759 NA|NA|NA U Vacuolar protein sorting-associated protein Pdr6g003920 225117.XP_009371857.1 0.0 1128.6 fabids CT-BMY GO:0000023,GO:0000024,GO:0000272,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004553,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005975,GO:0005976,GO:0005982,GO:0005983,GO:0005984,GO:0006073,GO:0006950,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009057,GO:0009058,GO:0009251,GO:0009266,GO:0009311,GO:0009312,GO:0009409,GO:0009507,GO:0009532,GO:0009536,GO:0009570,GO:0009628,GO:0009987,GO:0016051,GO:0016052,GO:0016160,GO:0016161,GO:0016787,GO:0016798,GO:0034637,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0044042,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044247,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044262,GO:0044264,GO:0044275,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044434,GO:0044435,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044464,GO:0046351,GO:0050896,GO:0071704,GO:1901575,GO:1901576 3.2.1.2 ko:K01177 ko00500,map00500 R02112,R11262 ko00000,ko00001,ko01000 GH14 Viridiplantae 2CJU3@1,2QTBX@2759,37IM6@33090,3GDU5@35493,4JE5V@91835 NA|NA|NA G Beta-amylase Pdr6g003930 102107.XP_008235075.1 7.2e-82 310.8 fabids Viridiplantae 2CXS5@1,2RZBX@2759,37UWE@33090,3GIG1@35493,4JT1D@91835 NA|NA|NA S F-box kelch-repeat protein Pdr6g003940 102107.XP_008235075.1 3.5e-42 178.3 fabids Viridiplantae 2CXS5@1,2RZBX@2759,37UWE@33090,3GIG1@35493,4JT1D@91835 NA|NA|NA S F-box kelch-repeat protein Pdr6g003950 225117.XP_009371856.1 1.4e-217 761.9 fabids Viridiplantae 37IP7@33090,3G8RT@35493,4JRP0@91835,COG0515@1,KOG1187@2759 NA|NA|NA T Belongs to the protein kinase superfamily Pdr6g003960 102107.XP_008229490.1 6e-45 186.4 Streptophyta ko:K02921 ko03010,map03010 M00177,M00179 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Viridiplantae 37V8X@33090,3GJH4@35493,COG1997@1,KOG0402@2759 NA|NA|NA J rRNA binding Pdr6g003970 225117.XP_009371854.1 1.7e-78 300.1 fabids ko:K19530 ko00000 Viridiplantae 37J9P@33090,3GCBR@35493,4JS3U@91835,COG4642@1,KOG0231@2759 NA|NA|NA S Possible plasma membrane-binding motif in junctophilins, PIP-5-kinases and protein kinases. Pdr6g003980 225117.XP_009371848.1 2e-160 571.6 fabids ko:K03115 ko03008,ko04064,ko04137,ko04139,ko04310,ko04520,ko04712,ko05162,ko05168,ko05169,map03008,map04064,map04137,map04139,map04310,map04520,map04712,map05162,map05168,map05169 ko00000,ko00001,ko03009 Viridiplantae 37N3F@33090,3G8JE@35493,4JN6E@91835,COG5041@1,KOG3092@2759 NA|NA|NA DKT Plays a complex role in regulating the basal catalytic activity of the alpha subunit Pdr6g003990 3750.XP_008360792.1 3.1e-21 107.5 fabids 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Decapping nuclease DXO homolog Pdr6g004020 3750.XP_008346514.1 3.8e-39 167.5 fabids GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006066,GO:0006082,GO:0006629,GO:0006714,GO:0006720,GO:0006721,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008299,GO:0008610,GO:0009058,GO:0009507,GO:0009526,GO:0009536,GO:0009687,GO:0009688,GO:0009941,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016106,GO:0016108,GO:0016109,GO:0016114,GO:0016116,GO:0016117,GO:0016122,GO:0016123,GO:0019222,GO:0019752,GO:0031323,GO:0031967,GO:0031975,GO:0032787,GO:0032928,GO:0042440,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043288,GO:0043289,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044434,GO:0044435,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044464,GO:0046148,GO:0046165,GO:0046394,GO:0050789,GO:0050794,GO:0065007,GO:0071704,GO:0072330,GO:0090322,GO:1901576,GO:1901615,GO:1901617,GO:1902644,GO:1902645,GO:2000377 Viridiplantae 28P8V@1,2QVVZ@2759,37MSM@33090,3GGVN@35493,4JH4G@91835 NA|NA|NA S Domain of unknown function (DUF4281) Pdr6g004040 225117.XP_009371847.1 2.3e-136 491.5 fabids GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006066,GO:0006082,GO:0006629,GO:0006714,GO:0006720,GO:0006721,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008299,GO:0008610,GO:0009058,GO:0009507,GO:0009526,GO:0009536,GO:0009687,GO:0009688,GO:0009941,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016106,GO:0016108,GO:0016109,GO:0016114,GO:0016116,GO:0016117,GO:0016122,GO:0016123,GO:0019222,GO:0019752,GO:0031323,GO:0031967,GO:0031975,GO:0032787,GO:0032928,GO:0042440,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043288,GO:0043289,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044434,GO:0044435,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044464,GO:0046148,GO:0046165,GO:0046394,GO:0050789,GO:0050794,GO:0065007,GO:0071704,GO:0072330,GO:0090322,GO:1901576,GO:1901615,GO:1901617,GO:1902644,GO:1902645,GO:2000377 Viridiplantae 28P8V@1,2QVVZ@2759,37MSM@33090,3GGVN@35493,4JH4G@91835 NA|NA|NA S Domain of unknown function 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The electrons required for the hydroxylation reaction may be funneled indirectly from NADPH via a ferredoxin ferredoxin reductase system to COQ6 Pdr6g009050 225117.XP_009334476.1 0.0 1097.4 fabids ko:K19613 ko04014,map04014 ko00000,ko00001 Viridiplantae 37S9E@33090,3G93J@35493,4JNSV@91835,KOG4658@1,KOG4658@2759 NA|NA|NA T Belongs to the disease resistance NB-LRR family Pdr6g009060 3750.XP_008374297.1 4.3e-97 361.7 Streptophyta ko:K13459 ko04626,map04626 ko00000,ko00001 Viridiplantae 37YXJ@33090,3GHMT@35493,COG2801@1,KOG0017@2759 NA|NA|NA L Mitochondrial protein Pdr6g009070 225117.XP_009334467.1 0.0 1548.5 fabids 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This arginylation is required for degradation of the protein via the ubiquitin pathway Pdr7g016720 225117.XP_009369154.1 3.7e-69 267.3 fabids Viridiplantae 37URJ@33090,3GIV0@35493,4JU2W@91835,KOG3399@1,KOG3399@2759 NA|NA|NA S Yippee-like Pdr7g016730 225117.XP_009369266.1 1.9e-122 445.3 Streptophyta LHCB4 GO:0003674,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006091,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009314,GO:0009416,GO:0009503,GO:0009507,GO:0009526,GO:0009532,GO:0009534,GO:0009535,GO:0009536,GO:0009570,GO:0009579,GO:0009628,GO:0009637,GO:0009639,GO:0009765,GO:0009768,GO:0009941,GO:0009987,GO:0010114,GO:0010218,GO:0010287,GO:0015979,GO:0016020,GO:0016168,GO:0019684,GO:0030076,GO:0031409,GO:0031967,GO:0031975,GO:0031976,GO:0031984,GO:0032991,GO:0034357,GO:0042651,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0044237,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044434,GO:0044435,GO:0044436,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044464,GO:0046906,GO:0048037,GO:0050896,GO:0055035,GO:0097159,GO:0098796,GO:0098807,GO:1901363 ko:K08915 ko00196,ko01100,map00196,map01100 ko00000,ko00001,ko00194 Viridiplantae 28J54@1,2QRH9@2759,37TQN@33090,3GEZB@35493 NA|NA|NA P The light-harvesting complex (LHC) functions as a light receptor, it captures and delivers excitation energy to photosystems with which it is closely associated Pdr7g016740 225117.XP_009369155.1 6e-59 233.8 fabids ko:K10802,ko:K11296 ko03410,ko04140,ko04217,map03410,map04140,map04217 ko00000,ko00001,ko03036,ko03400,ko04147 Viridiplantae 37U7W@33090,3GJ1B@35493,4JU15@91835,COG5648@1,KOG0381@2759 NA|NA|NA K High mobility group B protein Pdr7g016750 225117.XP_009369157.1 6.4e-276 956.1 fabids CPD GO:0000003,GO:0003006,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004497,GO:0006629,GO:0006694,GO:0007275,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008202,GO:0008610,GO:0009058,GO:0009314,GO:0009411,GO:0009416,GO:0009555,GO:0009628,GO:0009653,GO:0009791,GO:0009908,GO:0009909,GO:0009911,GO:0009987,GO:0010208,GO:0010224,GO:0010268,GO:0010584,GO:0010817,GO:0010927,GO:0016043,GO:0016125,GO:0016128,GO:0016129,GO:0016131,GO:0016132,GO:0016491,GO:0022414,GO:0022607,GO:0030154,GO:0030198,GO:0032501,GO:0032502,GO:0032989,GO:0042445,GO:0042446,GO:0042592,GO:0043062,GO:0044085,GO:0044238,GO:0045229,GO:0048229,GO:0048367,GO:0048437,GO:0048438,GO:0048443,GO:0048444,GO:0048448,GO:0048449,GO:0048455,GO:0048466,GO:0048518,GO:0048580,GO:0048582,GO:0048608,GO:0048646,GO:0048653,GO:0048654,GO:0048655,GO:0048656,GO:0048657,GO:0048658,GO:0048731,GO:0048827,GO:0048831,GO:0048856,GO:0048869,GO:0048878,GO:0050789,GO:0050793,GO:0050896,GO:0051094,GO:0051239,GO:0051240,GO:0055088,GO:0055114,GO:0061458,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071704,GO:0071840,GO:0080132,GO:0085029,GO:0090567,GO:0090696,GO:0090697,GO:0090698,GO:0099402,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901576,GO:1901615,GO:1901617,GO:1905392,GO:1905393,GO:2000026,GO:2000241,GO:2000243 ko:K09588,ko:K09590 ko00905,ko01100,ko01110,map00905,map01100,map01110 M00371 R07450,R07451,R07455,R07457,R07458,R10669 RC00154,RC00661,RC02079 ko00000,ko00001,ko00002,ko00199,ko01000 Viridiplantae 37KN9@33090,3G7WM@35493,4JF18@91835,COG2124@1,KOG0157@2759 NA|NA|NA Q Cytochrome p450 Pdr7g016760 225117.XP_009369159.1 2.1e-103 381.7 fabids Viridiplantae 37IAS@33090,3GDHH@35493,4JKDB@91835,COG0596@1,KOG1454@2759 NA|NA|NA S regulation of endocannabinoid signaling pathway Pdr7g016770 225117.XP_009369160.1 4.2e-268 931.0 fabids GO:0003674,GO:0005215 ko:K08869 ko00000,ko01001 Viridiplantae 37PSD@33090,3GBQI@35493,4JJX3@91835,COG0661@1,KOG1235@2759 NA|NA|NA S ABC1 protein Pdr7g016780 225117.XP_009369163.1 1.2e-126 459.1 fabids GO:0000413,GO:0003674,GO:0003755,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005768,GO:0005770,GO:0005771,GO:0005783,GO:0005794,GO:0005795,GO:0005829,GO:0006464,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0012505,GO:0016020,GO:0016853,GO:0016859,GO:0018193,GO:0018208,GO:0019538,GO:0031410,GO:0031982,GO:0031984,GO:0036211,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044431,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044464,GO:0071704,GO:0097708,GO:0098791,GO:0140096,GO:1901564 5.2.1.8 ko:K01802 ko00000,ko01000 Viridiplantae 37MAX@33090,3GGHC@35493,4JT0I@91835,COG0652@1,KOG0865@2759 NA|NA|NA O PPIases accelerate the folding of proteins. 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37NMH@33090,3G8HJ@35493,4JK5P@91835,COG5088@1,KOG4086@2759 NA|NA|NA K Component of the Mediator complex, a coactivator involved in the regulated transcription of nearly all RNA polymerase II-dependent genes. Mediator functions as a bridge to convey information from gene-specific regulatory proteins to the basal RNA polymerase II transcription machinery. 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Acts as an exoribonuclease (RNase) responsible for trimming the poly(U) tract of the last nucleotides in the pre-U6 snRNA molecule, leading to the formation of mature U6 snRNA Pdr7g018280 3750.XP_008364870.1 1.3e-139 502.7 fabids GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005737,GO:0008150,GO:0009507,GO:0009536,GO:0009889,GO:0009891,GO:0009893,GO:0019216,GO:0019222,GO:0019747,GO:0031323,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031328,GO:0031647,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045828,GO:0045834,GO:0046889,GO:0046890,GO:0048518,GO:0048522,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050821,GO:0065007,GO:0065008,GO:0080090,GO:1904143 Viridiplantae 28NS1@1,2QVC3@2759,37KMB@33090,3G77B@35493,4JKR5@91835 NA|NA|NA S Encodes a close homolog of the Cauliflower OR (Orange) protein. The function of OR is to induce the differentiation of proplastids or other noncolored plastids into chromoplasts for carotenoid accumulation. 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Acts as an exoribonuclease (RNase) responsible for trimming the poly(U) tract of the last nucleotides in the pre-U6 snRNA molecule, leading to the formation of mature U6 snRNA Pdr7g018330 225117.XP_009363728.1 1.8e-122 445.7 fabids GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005737,GO:0008150,GO:0009507,GO:0009536,GO:0009889,GO:0009891,GO:0009893,GO:0019216,GO:0019222,GO:0019747,GO:0031323,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031328,GO:0031647,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045828,GO:0045834,GO:0046889,GO:0046890,GO:0048518,GO:0048522,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050821,GO:0065007,GO:0065008,GO:0080090,GO:1904143 Viridiplantae 28NS1@1,2QVC3@2759,37KMB@33090,3G77B@35493,4JKR5@91835 NA|NA|NA S Encodes a close homolog of the Cauliflower OR (Orange) protein. The function of OR is to induce the differentiation of proplastids or other noncolored plastids into chromoplasts for carotenoid accumulation. Both proteins contain a Cysteine-rich Pdr7g018340 225117.XP_009363733.1 1.5e-48 198.7 Eukaryota GO:0003674,GO:0003824,GO:0004806,GO:0005575,GO:0005576,GO:0005615,GO:0016298,GO:0016787,GO:0016788,GO:0044421,GO:0052689 3.1.1.13 ko:K01052 ko00100,ko04142,ko04979,map00100,map04142,map04979 R01462 RC00055,RC00523 ko00000,ko00001,ko01000 Eukaryota COG0596@1,KOG2624@2759 NA|NA|NA C hydrolase activity, acting on ester bonds Pdr7g018350 3750.XP_008361105.1 0.0 1171.4 Streptophyta Viridiplantae 2SI7S@2759,37QD6@33090,3GCW1@35493,COG4886@1 NA|NA|NA S RESISTANCE protein Pdr7g018360 225117.XP_009363726.1 1.1e-41 176.8 fabids Viridiplantae 37RGI@33090,3GAB5@35493,4JKYB@91835,KOG3102@1,KOG3102@2759 NA|NA|NA J Phosphodiesterase responsible for the U6 snRNA 3' end processing. Acts as an exoribonuclease (RNase) responsible for trimming the poly(U) tract of the last nucleotides in the pre-U6 snRNA molecule, leading to the formation of mature U6 snRNA Pdr7g018380 225117.XP_009363728.1 2.9e-85 321.6 fabids GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005737,GO:0008150,GO:0009507,GO:0009536,GO:0009889,GO:0009891,GO:0009893,GO:0019216,GO:0019222,GO:0019747,GO:0031323,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031328,GO:0031647,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045828,GO:0045834,GO:0046889,GO:0046890,GO:0048518,GO:0048522,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050821,GO:0065007,GO:0065008,GO:0080090,GO:1904143 Viridiplantae 28NS1@1,2QVC3@2759,37KMB@33090,3G77B@35493,4JKR5@91835 NA|NA|NA S Encodes a close homolog of the Cauliflower OR (Orange) protein. The function of OR is to induce the differentiation of proplastids or other noncolored plastids into chromoplasts for carotenoid accumulation. Both proteins contain a Cysteine-rich Pdr7g018390 225117.XP_009363733.1 9.2e-51 206.1 Eukaryota GO:0003674,GO:0003824,GO:0004806,GO:0005575,GO:0005576,GO:0005615,GO:0016298,GO:0016787,GO:0016788,GO:0044421,GO:0052689 3.1.1.13 ko:K01052 ko00100,ko04142,ko04979,map00100,map04142,map04979 R01462 RC00055,RC00523 ko00000,ko00001,ko01000 Eukaryota COG0596@1,KOG2624@2759 NA|NA|NA C hydrolase activity, acting on ester bonds Pdr7g018400 225117.XP_009370407.1 0.0 1357.0 Viridiplantae Viridiplantae 2QWPX@2759,37KD9@33090,COG4886@1 NA|NA|NA S RESISTANCE protein Pdr7g018410 57918.XP_004292511.1 4.5e-95 354.4 Streptophyta Viridiplantae 3884A@33090,3GPQE@35493,COG2801@1,KOG0017@2759 NA|NA|NA L mitochondrial protein AtMg00810-like Pdr7g018420 3750.XP_008338000.1 3.8e-129 467.6 Viridiplantae Viridiplantae 37W11@33090,COG2801@1,KOG0017@2759 NA|NA|NA L transposition, RNA-mediated Pdr7g018430 225117.XP_009370410.1 0.0 1094.3 fabids 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The function of OR is to induce the differentiation of proplastids or other noncolored plastids into chromoplasts for carotenoid accumulation. Both proteins contain a Cysteine-rich Pdr7g019090 225117.XP_009363726.1 2e-77 295.8 fabids Viridiplantae 37RGI@33090,3GAB5@35493,4JKYB@91835,KOG3102@1,KOG3102@2759 NA|NA|NA J Phosphodiesterase responsible for the U6 snRNA 3' end processing. 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Acts as an exoribonuclease (RNase) responsible for trimming the poly(U) tract of the last nucleotides in the pre-U6 snRNA molecule, leading to the formation of mature U6 snRNA Pdr7g019130 3750.XP_008357094.1 0.0 1926.8 fabids GO:0003674,GO:0003678,GO:0003824,GO:0004386,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006310,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016043,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0017111,GO:0032392,GO:0032508,GO:0034641,GO:0036292,GO:0043138,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0046483,GO:0051276,GO:0071103,GO:0071704,GO:0071840,GO:0090304,GO:0140097,GO:1901360 Viridiplantae 37KYC@33090,3GCYH@35493,4JFWH@91835,COG0210@1,COG2801@1,KOG0017@2759,KOG2108@2759 NA|NA|NA L ATP-dependent DNA helicase Pdr7g019140 225117.XP_009363737.1 1.9e-165 589.0 fabids ko:K21435 ko00000,ko03036 Viridiplantae 37QKN@33090,3GDJ5@35493,4JTQH@91835,COG0666@1,KOG0504@2759 NA|NA|NA S ankyrin repeat-containing protein Pdr7g019150 225117.XP_009363736.1 1.5e-167 595.9 fabids ko:K21435 ko00000,ko03036 Viridiplantae 37QKN@33090,3GDJ5@35493,4JTQH@91835,COG0666@1,KOG0504@2759 NA|NA|NA S ankyrin repeat-containing protein Pdr7g019160 225117.XP_009363738.1 4.1e-284 983.4 fabids Viridiplantae 37JW7@33090,3GAJD@35493,4JE5T@91835,KOG1398@1,KOG1398@2759 NA|NA|NA S N-terminal cysteine-rich region of Transmembrane protein 135 Pdr7g019170 225117.XP_009363739.1 1.8e-239 834.7 fabids GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004352,GO:0004353,GO:0005488,GO:0005507,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005739,GO:0005773,GO:0005774,GO:0006950,GO:0006970,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0009628,GO:0009651,GO:0010035,GO:0010038,GO:0016020,GO:0016491,GO:0016638,GO:0016639,GO:0017076,GO:0030554,GO:0031090,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0035639,GO:0036094,GO:0042221,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044437,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044464,GO:0046686,GO:0046872,GO:0046914,GO:0050896,GO:0050897,GO:0055114,GO:0097159,GO:0097367,GO:0098588,GO:0098805,GO:1901265,GO:1901363 1.4.1.3 ko:K00261 ko00220,ko00250,ko00471,ko00910,ko01100,ko01200,ko04217,ko04964,map00220,map00250,map00471,map00910,map01100,map01200,map04217,map04964 M00740 R00243,R00248 RC00006,RC02799 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko04147 Viridiplantae 37Q3I@33090,3GC9F@35493,4JRW9@91835,COG0334@1,KOG2250@2759 NA|NA|NA E Belongs to the Glu Leu Phe Val dehydrogenases family Pdr7g019180 225117.XP_009363740.1 2.7e-82 311.6 fabids GO:0000428,GO:0003674,GO:0003712,GO:0003713,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005667,GO:0006355,GO:0006357,GO:0008150,GO:0009889,GO:0009891,GO:0009893,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010604,GO:0016591,GO:0016592,GO:0019219,GO:0019222,GO:0030880,GO:0031323,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031328,GO:0031974,GO:0031981,GO:0032991,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043233,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044428,GO:0044446,GO:0044451,GO:0044464,GO:0044798,GO:0045935,GO:0048518,GO:0048522,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051173,GO:0051252,GO:0051254,GO:0055029,GO:0060255,GO:0061695,GO:0065007,GO:0070013,GO:0070847,GO:0080090,GO:0090575,GO:0140110,GO:1902494,GO:1902680,GO:1903506,GO:1903508,GO:1990234,GO:2000112,GO:2001141 ko:K15153 ko00000,ko03021 Viridiplantae 37NMH@33090,3G8HJ@35493,4JK5P@91835,COG5088@1,KOG4086@2759 NA|NA|NA K Component of the Mediator complex, a coactivator involved in the regulated transcription of nearly all RNA polymerase II-dependent genes. Mediator functions as a bridge to convey information from gene-specific regulatory proteins to the basal RNA polymerase II transcription machinery. Mediator is recruited to promoters by direct interactions with regulatory proteins and serves as a scaffold for the assembly of a functional preinitiation complex with RNA polymerase II and the general transcription factors Pdr7g019190 225117.XP_009363742.1 1.5e-118 432.2 fabids 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It catalyzes the cis-trans isomerization of proline imidic peptide bonds in oligopeptides Pdr8g011810 3750.XP_008351907.1 4.6e-96 359.0 Streptophyta Viridiplantae 37TIF@33090,3G9IZ@35493,KOG1075@1,KOG1075@2759 NA|NA|NA L ribonuclease H protein Pdr8g011820 225117.XP_009373660.1 1.2e-288 999.2 fabids GO:0003674,GO:0003824,GO:0004733,GO:0005575,GO:0005576,GO:0005615,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005737,GO:0005739,GO:0005759,GO:0005829,GO:0006081,GO:0006139,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006733,GO:0006734,GO:0006739,GO:0006753,GO:0006766,GO:0006767,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009110,GO:0009117,GO:0009165,GO:0009435,GO:0009507,GO:0009536,GO:0009987,GO:0016491,GO:0016638,GO:0016641,GO:0016853,GO:0016854,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019359,GO:0019362,GO:0019363,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019674,GO:0031974,GO:0031981,GO:0034356,GO:0034641,GO:0034654,GO:0042364,GO:0042816,GO:0042819,GO:0042822,GO:0042823,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043233,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044421,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044428,GO:0044429,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044464,GO:0046184,GO:0046483,GO:0046496,GO:0051186,GO:0051188,GO:0052856,GO:0052857,GO:0055086,GO:0055114,GO:0070013,GO:0071704,GO:0072524,GO:0072525,GO:0090407,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901615,GO:1901617 1.4.3.5,5.1.99.6 ko:K00275,ko:K17759 ko00750,ko01100,ko01120,map00750,map01100,map01120 M00124 R00277,R00278,R01710,R01711 RC00048,RC00116 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Viridiplantae 37KAJ@33090,3GAVK@35493,4JH0G@91835,COG0062@1,COG0259@1,KOG2585@2759,KOG2586@2759 NA|NA|NA H Catalyzes the epimerization of the S- and R-forms of NAD(P)HX, a damaged form of NAD(P)H that is a result of enzymatic or heat-dependent hydration. This is a prerequisite for the S- specific NAD(P)H-hydrate dehydratase to allow the repair of both epimers of NAD(P)HX Pdr8g011830 225117.XP_009373638.1 2.6e-58 231.9 fabids GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005794,GO:0005886,GO:0006873,GO:0006875,GO:0006883,GO:0008150,GO:0009987,GO:0012505,GO:0016020,GO:0019725,GO:0030003,GO:0030004,GO:0042592,GO:0043181,GO:0043182,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0047484,GO:0048518,GO:0048583,GO:0048584,GO:0048878,GO:0050789,GO:0050801,GO:0051179,GO:0051235,GO:0051641,GO:0051651,GO:0055065,GO:0055067,GO:0055078,GO:0055080,GO:0055082,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071944,GO:0080134,GO:0098771,GO:1901000,GO:1901002 ko:K08505 ko04130,map04130 ko00000,ko00001,ko04131 Viridiplantae 37UM9@33090,3GJ46@35493,4JPID@91835,KOG1267@1,KOG1267@2759 NA|NA|NA K Bet1-like protein Pdr8g011840 3750.XP_008338906.1 2e-130 472.2 fabids Viridiplantae 28M8Q@1,2QTRX@2759,37HUM@33090,3GC8S@35493,4JRT4@91835 NA|NA|NA S 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queuine (Q) at position 34 (anticodon wobble position) in tRNAs with GU(N) anticodons (tRNA-Asp, -Asn, -His and -Tyr), resulting in the hypermodified nucleoside queuosine (7-(((4,5-cis- dihydroxy-2-cyclopenten-1-yl)amino)methyl)-7-deazaguanosine). Catalysis occurs through a double-displacement mechanism. The nucleophile active site attacks the C1' of nucleotide 34 to detach the guanine base from the RNA, forming a covalent enzyme-RNA intermediate. The proton acceptor active site deprotonates the incoming queuine, allowing a nucleophilic attack on the C1' of the ribose to form the product Pdr8g012250 225117.XP_009339813.1 1.4e-56 225.7 fabids 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2.7.7.48 ko:K11699 ko00000,ko01000,ko03036 Viridiplantae 37SIA@33090,3G9P0@35493,4JEHX@91835,KOG0988@1,KOG0988@2759 NA|NA|NA A Probably involved in the RNA silencing pathway and required for the generation of small interfering RNAs (siRNAs) Pdr8g016510 4081.Solyc01g007470.1.1 3.6e-47 194.1 Streptophyta rpl20 GO:0000027,GO:0003674,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006996,GO:0008150,GO:0009507,GO:0009526,GO:0009532,GO:0009536,GO:0009570,GO:0009941,GO:0009987,GO:0016043,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0031967,GO:0031975,GO:0034622,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042273,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044434,GO:0044435,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044464,GO:0065003,GO:0070925,GO:0071826,GO:0071840 ko:K02887 ko03010,map03010 M00178 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Viridiplantae 37VVT@33090,3GJCY@35493,COG0292@1,KOG4707@2759 NA|NA|NA J Binds directly to 23S ribosomal RNA and is necessary for the in vitro assembly process of the 50S ribosomal subunit. It is not involved in the protein synthesizing functions of that subunit Pdr8g016520 13333.ERN11400 3.5e-109 401.4 Streptophyta psbC ko:K02705 ko00195,ko01100,map00195,map01100 M00161 ko00000,ko00001,ko00002,ko00194 Viridiplantae 28ISP@1,2QR3X@2759,37T53@33090,3G7SE@35493 NA|NA|NA C One of the components of the core complex of photosystem II (PSII). It binds chlorophyll and helps catalyze the primary light-induced photochemical processes of PSII. PSII is a light- driven water plastoquinone oxidoreductase, using light energy to abstract electrons from H(2)O, generating O(2) and a proton gradient subsequently used for ATP formation Pdr8g016530 225117.XP_009376926.1 3.1e-195 687.6 fabids 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2AME0@1,2RZBV@2759,37UPQ@33090,3GY1B@35493,4JW84@91835 NA|NA|NA S isoform X1 Pdr8g016580 225117.XP_009355736.1 3.1e-200 704.9 fabids GO:0001101,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004620,GO:0004630,GO:0006629,GO:0006643,GO:0006950,GO:0006970,GO:0007275,GO:0008081,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008610,GO:0009056,GO:0009058,GO:0009414,GO:0009415,GO:0009628,GO:0009651,GO:0009719,GO:0009725,GO:0009737,GO:0009987,GO:0010033,GO:0010035,GO:0016042,GO:0016298,GO:0016787,GO:0016788,GO:0022622,GO:0032501,GO:0032502,GO:0033993,GO:0042221,GO:0042578,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044242,GO:0044248,GO:0044255,GO:0046466,GO:0048364,GO:0048731,GO:0048856,GO:0050896,GO:0071704,GO:0097305,GO:0099402,GO:1901575,GO:1901576,GO:1901700 3.1.4.4 ko:K01115 ko00564,ko00565,ko01100,ko01110,ko04014,ko04024,ko04071,ko04072,ko04144,ko04666,ko04724,ko04912,ko05231,map00564,map00565,map01100,map01110,map04014,map04024,map04071,map04072,map04144,map04666,map04724,map04912,map05231 R01310,R02051,R07385 RC00017,RC00425 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Coatomer complex is required for budding from Golgi membranes, and is essential for the retrograde Golgi-to-ER transport of dilysine-tagged proteins Pdr9g000420 225117.XP_009341850.1 6.6e-198 696.4 fabids Viridiplantae 37PEK@33090,3G7HP@35493,4JM6R@91835,COG5035@1,KOG2952@2759 NA|NA|NA DKT ALA-interacting subunit Pdr9g000430 225117.XP_009367106.1 0.0 1399.0 fabids 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PSI is a plastocyanin-ferredoxin oxidoreductase, converting photonic excitation into a charge separation, which transfers an electron from the donor P700 chlorophyll pair to the spectroscopically characterized acceptors A0, A1, FX, FA and FB in turn Pdr9g005210 29760.VIT_00s0246g00170.t01 2.8e-142 511.5 Streptophyta ccsA GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006810,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009536,GO:0015886,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051181,GO:0051234,GO:0055114,GO:0071702,GO:0071705,GO:1901678 Viridiplantae 2QU0T@2759,37NBU@33090,3GH1G@35493,COG0755@1 NA|NA|NA O Cytochrome c biogenesis protein CcsA Pdr9g005230 3750.XP_008387803.1 1.1e-47 196.1 fabids 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Part of an electron transfer chain functioning in an early step of cytosolic Fe-S biogenesis. 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Required for establishment of the Casparian strip membrane domain (CSD) and the subsequent formation of Casparian strips, a cell wall modification of the root endodermis that determines an apoplastic barrier between the intraorganismal apoplasm and the extraorganismal apoplasm and prevents lateral diffusion (By similarity) Pdr9g016310 225117.XP_009376285.1 0.0 2030.4 fabids GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003824,GO:0004518,GO:0004519,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0006139,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009451,GO:0009987,GO:0016070,GO:0016787,GO:0016788,GO:0034641,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046483,GO:0048037,GO:0051536,GO:0051540,GO:0071704,GO:0090304,GO:0090305,GO:0097159,GO:1901360,GO:1901363 Viridiplantae 37KIA@33090,3GGXZ@35493,4JM9K@91835,KOG4197@1,KOG4197@2759 NA|NA|NA S Pentatricopeptide repeat-containing protein Pdr9g016320 3750.XP_008341589.1 9.5e-19 98.6 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May act as a fidelity factor of the translation reaction, by catalyzing a one- codon backward translocation of tRNAs on improperly translocated ribosomes. 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The FACT complex is involved in multiple processes that require DNA as a template such as mRNA elongation, DNA replication and DNA repair. During transcription elongation the FACT complex acts as a histone chaperone that both destabilizes and restores nucleosomal structure. It facilitates the passage of RNA polymerase II and transcription by promoting the dissociation of one histone H2A-H2B dimer from the nucleosome, then subsequently promotes the reestablishment of the nucleosome following the passage of RNA polymerase II Pdr9g016900 225117.XP_009342871.1 3.6e-268 930.2 fabids 4.2.2.2 ko:K01728 ko00040,ko02024,map00040,map02024 R02361,R06240 RC00049,RC00705 ko00000,ko00001,ko01000 Viridiplantae 2QQE2@2759,37MWG@33090,3G8Z1@35493,4JM1X@91835,COG3866@1 NA|NA|NA G Pectate lyase Pdr9g016910 225117.XP_009342872.1 1.2e-189 669.1 fabids PIN8 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The transcription regulatory histone acetylation (HAT) complex SAGA is a multiprotein complex that activates transcription by remodeling chromatin and mediating histone acetylation and deubiquitination. Within the SAGA complex, participates to a subcomplex that specifically deubiquitinates histones. The SAGA complex is recruited to specific gene promoters by activators, where it is required for transcription. The TREX-2 complex functions in docking export-competent ribonucleoprotein particles (mRNPs) to the nuclear entrance of the nuclear pore complex (nuclear basket). 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37MAM@33090,3G8RS@35493,4JE4K@91835,KOG0988@1,KOG0988@2759 NA|NA|NA A Probably involved in the RNA silencing pathway and required for the generation of small interfering RNAs (siRNAs) Pdr0g005580 3750.XP_008389973.1 3.5e-203 714.1 fabids Viridiplantae 28IIJ@1,2QUIN@2759,37QVS@33090,3GBG7@35493,4JEGJ@91835 NA|NA|NA S S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase Pdr0g005590 3750.XP_008389157.1 0.0 1222.2 fabids Viridiplantae 2C0EY@1,2QRGU@2759,37PWN@33090,3G7H5@35493,4JKNY@91835 NA|NA|NA S MACPF domain-containing protein Pdr0g005600 3750.XP_008389972.1 9.4e-64 249.6 Streptophyta Viridiplantae 37WYX@33090,3GKSX@35493,KOG0773@1,KOG0773@2759 NA|NA|NA K Homeobox protein knotted-1-like Pdr0g005610 3750.XP_008360024.1 1.4e-202 712.2 fabids GO:0003674,GO:0003700,GO:0006355,GO:0008150,GO:0009889,GO:0010468,GO:0010556,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031326,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051252,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:0140110,GO:1903506,GO:2000112,GO:2001141 ko:K09419 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peptides with Arg, Phe, Tyr, Leu, and Glu adjacent to the leaving group at neutral or slightly basic pH Pdr0g010400 225117.XP_009370021.1 0.0 1922.1 fabids 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the ER, via the Golgi up to the trans Golgi network. 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Microtubule severing may promote rapid reorganization of cellular microtubule arrays Pdr0g013620 225117.XP_009343426.1 0.0 2654.8 fabids Viridiplantae 37P62@33090,3GB0P@35493,4JSIG@91835,COG1131@1,KOG0065@2759 NA|NA|NA Q Belongs to the ABC transporter superfamily. ABCG family. 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2.7.7.48 ko:K11699 ko00000,ko01000,ko03036 Viridiplantae 37SIA@33090,3G9P0@35493,4JEHX@91835,KOG0988@1,KOG0988@2759 NA|NA|NA A Probably involved in the RNA silencing pathway and required for the generation of small interfering RNAs (siRNAs) Pdr0g013750 3750.XP_008347870.1 7.5e-80 305.4 fabids GO:0003333,GO:0003674,GO:0005215,GO:0005342,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006820,GO:0006865,GO:0008150,GO:0008509,GO:0008514,GO:0015075,GO:0015171,GO:0015318,GO:0015711,GO:0015849,GO:0016020,GO:0022857,GO:0034220,GO:0044464,GO:0046942,GO:0046943,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0098656,GO:1903825,GO:1905039 Viridiplantae 37Q02@33090,3GDMW@35493,4JJA4@91835,COG0814@1,KOG1303@2759 NA|NA|NA E Lysine histidine transporter-like Pdr0g013760 225117.XP_009333642.1 1.2e-216 758.8 fabids Viridiplantae 2CGU3@1,2QRP6@2759,37QPU@33090,3GAWZ@35493,4JVU2@91835 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF642) Pdr0g013770 3750.XP_008382525.1 4.7e-23 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It catalyzes the synthesis of the activated glycosyl donor, ADP- glucose from Glc-1-P and ATP Pdr0g016120 102107.XP_008236920.1 2.5e-150 538.5 fabids Viridiplantae 37KES@33090,3GCRB@35493,4JF44@91835,COG0517@1,KOG1764@2759 NA|NA|NA C SNF1-related protein kinase regulatory subunit Pdr0g016130 102107.XP_008236922.1 5.7e-25 120.2 fabids 2.1.1.141,2.1.1.273,2.1.1.274,2.1.1.277 ko:K08241,ko:K21482,ko:K21483,ko:K21485 ko00592,ko01110,map00592,map01110 R05759 RC00003,RC00460 ko00000,ko00001,ko01000 Viridiplantae 28IIJ@1,2QQVK@2759,37SA4@33090,3G9SP@35493,4JTHT@91835 NA|NA|NA S SAM dependent carboxyl methyltransferase Pdr0g016160 3750.XP_008385905.1 2.8e-304 1050.4 fabids DHFR-TS GO:0003674,GO:0003824,GO:0004146,GO:0004799,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006575,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006760,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008168,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009256,GO:0009257,GO:0009396,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016491,GO:0016645,GO:0016646,GO:0016740,GO:0016741,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019752,GO:0032259,GO:0034641,GO:0042083,GO:0042398,GO:0042558,GO:0042559,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043648,GO:0043650,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046483,GO:0046653,GO:0046654,GO:0051186,GO:0051188,GO:0055114,GO:0071704,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 1.5.1.3,2.1.1.45 ko:K13998 ko00240,ko00670,ko00790,ko01100,map00240,map00670,map00790,map01100 M00053,M00126,M00841 R00936,R00937,R00939,R00940,R02101,R02235,R02236 RC00109,RC00110,RC00158,RC00219,RC00332 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Viridiplantae 37IFR@33090,3GAR2@35493,4JIQB@91835,COG0207@1,COG0262@1,KOG0673@2759,KOG1324@2759 NA|NA|NA H Bifunctional enzyme. 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It catalyzes the cis-trans isomerization of proline imidic peptide bonds in oligopeptides Pdr0g019750 225117.XP_009377662.1 3.6e-155 554.3 fabids GO:0002252,GO:0002376,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005768,GO:0005769,GO:0005783,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006950,GO:0006952,GO:0008150,GO:0009605,GO:0009607,GO:0009615,GO:0012505,GO:0015693,GO:0016020,GO:0030001,GO:0031410,GO:0031982,GO:0043207,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043621,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051607,GO:0051704,GO:0051707,GO:0070838,GO:0071944,GO:0072511,GO:0097708,GO:0098542 Viridiplantae 37J5Y@33090,3GGWS@35493,4JE1W@91835,KOG2922@1,KOG2922@2759 NA|NA|NA P Acts as a Mg(2 ) transporter. Can also transport other divalent cations such as Fe(2 ), Sr(2 ), Ba(2 ), Mn(2 ) and Co(2 ) but to a much less extent than Mg(2 ) Pdr0g019760 225117.XP_009377668.1 5.7e-149 535.0 fabids Viridiplantae 2C1KS@1,2QWKA@2759,37IPB@33090,3GAJZ@35493,4JE4B@91835 NA|NA|NA S Pollen proteins Ole e I like Pdr0g019770 225117.XP_009377687.1 1.3e-261 908.7 Streptophyta 3.5.1.4 ko:K01426 ko00330,ko00360,ko00380,ko00627,ko00643,ko01120,map00330,map00360,map00380,map00627,map00643,map01120 R02540,R03096,R03180,R03909,R05551,R05590 RC00010,RC00100,RC00950,RC01025 ko00000,ko00001,ko01000 Viridiplantae 37JFQ@33090,3GBRU@35493,COG0154@1,KOG1211@2759 NA|NA|NA J amidase C869.01 Pdr0g019780 225117.XP_009377688.1 1.7e-304 1051.2 Streptophyta 3.5.1.4 ko:K01426 ko00330,ko00360,ko00380,ko00627,ko00643,ko01120,map00330,map00360,map00380,map00627,map00643,map01120 R02540,R03096,R03180,R03909,R05551,R05590 RC00010,RC00100,RC00950,RC01025 ko00000,ko00001,ko01000 Viridiplantae 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stereoselectivity on the phenoxy radical-coupling reaction, yielding optically active lignans from two molecules of coniferyl alcohol in the biosynthesis of lignans, flavonolignans, and alkaloids and thus plays a central role in plant secondary metabolism Pdr0g019830 225117.XP_009377671.1 0.0 2144.0 fabids TOC86 GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006605,GO:0006810,GO:0006886,GO:0008104,GO:0008150,GO:0009507,GO:0009526,GO:0009527,GO:0009536,GO:0009707,GO:0009941,GO:0015031,GO:0015833,GO:0016020,GO:0019867,GO:0031090,GO:0031967,GO:0031968,GO:0031969,GO:0031975,GO:0033036,GO:0033365,GO:0034613,GO:0042170,GO:0042886,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044434,GO:0044435,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044464,GO:0045036,GO:0045184,GO:0046907,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051641,GO:0051649,GO:0070727,GO:0071702,GO:0071705,GO:0072594,GO:0072596,GO:0072598,GO:0098588,GO:0098805 Viridiplantae 2CMP8@1,2QR60@2759,37MJT@33090,3GCW2@35493,4JIIG@91835 NA|NA|NA S 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May also have a chaperone function in the assembly of inner membrane protein complexes. Participates in the regulation of mitochondrial gene expression and in the maintenance of the integrity of the mitochondrial genome. 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NA|NA|NA U The coatomer is a cytosolic protein complex that binds to dilysine motifs and reversibly associates with Golgi non- clathrin-coated vesicles, which further mediate biosynthetic protein transport from the ER, via the Golgi up to the trans Golgi network. Coatomer complex is required for budding from Golgi membranes, and is essential for the retrograde Golgi-to-ER transport of dilysine-tagged proteins Pdr0g032200 225117.XP_009338984.1 1e-193 682.6 fabids GO:0003674,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0005911,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006820,GO:0008150,GO:0008272,GO:0008509,GO:0009506,GO:0015075,GO:0015103,GO:0015116,GO:0015318,GO:0015698,GO:0016020,GO:0016021,GO:0022857,GO:0030054,GO:0031224,GO:0031226,GO:0034220,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055044,GO:0055085,GO:0071944,GO:0072348,GO:0098656,GO:0098660,GO:0098661,GO:1901682,GO:1902358 ko:K17471 ko00000,ko02000 2.A.53.1 Viridiplantae 37RSK@33090,3G85B@35493,4JGWV@91835,COG0659@1,KOG0236@2759 NA|NA|NA P Sulfate transporter Pdr0g032210 225117.XP_009375083.1 8.4e-205 720.3 Streptophyta Viridiplantae 37TIF@33090,3G9IZ@35493,KOG1075@1,KOG1075@2759 NA|NA|NA L ribonuclease H protein Pdr0g032220 3750.XP_008373958.1 2.6e-79 302.4 fabids Viridiplantae 28PAW@1,2QVY8@2759,37TG3@33090,3GGWW@35493,4JKXD@91835 NA|NA|NA S superfamily. 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neutral or slightly basic pH Pdr0g034810 3750.XP_008352447.1 7.3e-91 339.7 Streptophyta GO:0000209,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004842,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005737,GO:0006464,GO:0006508,GO:0006511,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009057,GO:0009987,GO:0010498,GO:0016567,GO:0016740,GO:0019538,GO:0019787,GO:0019899,GO:0019941,GO:0030163,GO:0031625,GO:0032446,GO:0036211,GO:0043161,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043412,GO:0043632,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044257,GO:0044260,GO:0044265,GO:0044267,GO:0044389,GO:0044424,GO:0044464,GO:0051603,GO:0061630,GO:0061659,GO:0070647,GO:0071704,GO:0140096,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575 2.3.2.25 ko:K10688 ko04120,map04120 ko00000,ko00001,ko01000,ko04121 Viridiplantae 37QBF@33090,3GAXC@35493,COG5078@1,KOG0427@2759 NA|NA|NA O protein modification by small protein conjugation Pdr0g034820 4641.GSMUA_Achr8P14390_001 6.9e-15 85.9 Liliopsida 3.4.19.12 ko:K11842 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Catalyzes the formation of N(4)- acetylcytidine (ac4C) in 18S rRNA. Required for early nucleolar cleavages of precursor rRNA at sites A0, A1 and A2 during 18S rRNA synthesis. Catalyzes the formation of ac4C in serine and leucine tRNAs. 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receptor, it captures and delivers excitation energy to photosystems with which it is closely associated Pdr0g042910 225117.XP_009363584.1 1.1e-58 232.6 fabids 2.1.1.199 ko:K03438 ko00000,ko01000,ko03009 Viridiplantae 37I85@33090,3G8H7@35493,4JFJ9@91835,COG0275@1,KOG2782@2759 NA|NA|NA M Ribosomal RNA small subunit methyltransferase Pdr0g042920 3750.XP_008378517.1 0.0 1199.9 fabids Viridiplantae 28JT7@1,2QS72@2759,37Q8Q@33090,3GBTA@35493,4JF30@91835 NA|NA|NA S Domain found in Dishevelled, Egl-10, and Pleckstrin (DEP) Pdr0g042930 225117.XP_009367349.1 4.1e-218 763.8 fabids Viridiplantae 28JET@1,2QRTU@2759,37JJ7@33090,3G71D@35493,4JD7E@91835 NA|NA|NA S protein At4g37920, chloroplastic-like Pdr0g042940 225117.XP_009367348.1 1.2e-210 739.2 fabids Viridiplantae 28H7V@1,2QPKM@2759,37NTU@33090,3GH5W@35493,4JG78@91835 NA|NA|NA S Vacuolar sorting 38 and autophagy-related subunit 14 Pdr0g042950 225117.XP_009349162.1 0.0 1616.7 fabids 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and viral proteins. Some of these proteins have been shown both in vivo and in vitro to have ubiquitin E3 ligase activity. 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Some of these proteins have been shown both in vivo and in vitro to have ubiquitin E3 ligase activity. 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number of diverse aspects of plant physiology including growth and development, pest resistance, and senescence or responses to wounding Pdr0g047250 225117.XP_009376680.1 0.0 1552.7 fabids GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0044424,GO:0044464 1.13.11.58 ko:K15718 ko00591,map00591 R07057 RC00561 ko00000,ko00001,ko01000 Viridiplantae 28IFU@1,2QQSP@2759,37NCX@33090,3GAA6@35493,4JJ5S@91835 NA|NA|NA E Plant lipoxygenase may be involved in a number of diverse aspects of plant physiology including growth and development, pest resistance, and senescence or responses to wounding Pdr0g047260 225117.XP_009359358.1 2.4e-64 252.3 Streptophyta ko:K13459 ko04626,map04626 ko00000,ko00001 Viridiplantae 37YXJ@33090,3GHMT@35493,COG2801@1,KOG0017@2759 NA|NA|NA L Mitochondrial protein Pdr0g047270 225117.XP_009376662.1 0.0 1776.1 fabids GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0044424,GO:0044464 1.13.11.58 ko:K15718 ko00591,map00591 R07057 RC00561 ko00000,ko00001,ko01000 Viridiplantae 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neurosporene. 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misacylated Glu-tRNA(Gln) in chloroplasts and mitochondria. The reaction takes place in the presence of glutamine and ATP through an activated gamma-phospho- Glu-tRNA(Gln) Pdr0g051300 225117.XP_009350014.1 3.6e-189 667.5 fabids GO:0003674,GO:0003779,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005737,GO:0005856,GO:0005885,GO:0006996,GO:0007010,GO:0007015,GO:0008064,GO:0008092,GO:0008150,GO:0009987,GO:0010638,GO:0015629,GO:0016043,GO:0030029,GO:0030036,GO:0030832,GO:0030833,GO:0030838,GO:0031334,GO:0032271,GO:0032273,GO:0032535,GO:0032956,GO:0032970,GO:0032991,GO:0033043,GO:0034314,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043232,GO:0043254,GO:0044087,GO:0044089,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044430,GO:0044446,GO:0044464,GO:0044877,GO:0045010,GO:0048518,GO:0048522,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051015,GO:0051128,GO:0051130,GO:0051493,GO:0051495,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071840,GO:0090066,GO:0097435,GO:0110053,GO:1902903,GO:1902905 ko:K05757 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subunit of the queuine tRNA-ribosyltransferase (TGT) that catalyzes the base-exchange of a guanine (G) residue with queuine (Q) at position 34 (anticodon wobble position) in tRNAs with GU(N) anticodons (tRNA-Asp, -Asn, -His and -Tyr), resulting in the hypermodified nucleoside queuosine (7-(((4,5-cis- dihydroxy-2-cyclopenten-1-yl)amino)methyl)-7-deazaguanosine). Catalysis occurs through a double-displacement mechanism. The nucleophile active site attacks the C1' of nucleotide 34 to detach the guanine base from the RNA, forming a covalent enzyme-RNA intermediate. The proton acceptor active site deprotonates the incoming queuine, allowing a nucleophilic attack on the C1' of the ribose to form the product Pdr0g053300 225117.XP_009373264.1 4.3e-141 507.3 Viridiplantae Viridiplantae 37S51@33090,COG1028@1,KOG0725@2759 NA|NA|NA Q (-)-isopiperitenol (-)-carveol dehydrogenase, mitochondrial-like Pdr0g053310 225117.XP_009373250.1 0.0 1905.6 fabids Viridiplantae 37JJM@33090,3GD3C@35493,4JIJZ@91835,KOG3707@1,KOG3707@2759 NA|NA|NA S FAM91 N-terminus Pdr0g053320 3750.XP_008358199.1 1.1e-131 476.9 fabids Viridiplantae 2CXK1@1,2RY48@2759,37TVD@33090,3GAE2@35493,4JTQQ@91835 NA|NA|NA S UPF0481 protein Pdr0g053330 225117.XP_009342641.1 2.8e-58 232.3 fabids 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Mediates the second step in the final reaction sequence of coenzyme Q (CoQ) biosynthesis, which is the condensation of the polyisoprenoid side chain with PHB, generating the first membrane-bound Q intermediate Pdr0g055990 3750.XP_008390127.1 1.6e-277 961.4 fabids GO:0003674,GO:0003824,GO:0004497,GO:0005575,GO:0006629,GO:0006720,GO:0006721,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008299,GO:0008610,GO:0009058,GO:0009403,GO:0009404,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016101,GO:0016102,GO:0016114,GO:0016491,GO:0016705,GO:0016709,GO:0019748,GO:0036202,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044550,GO:0051501,GO:0051502,GO:0052314,GO:0052315,GO:0055114,GO:0071704,GO:1901576 1.14.13.145,1.14.13.192,1.14.13.193 ko:K16084,ko:K20556,ko:K21718 ko00904,ko01110,map00904,map01110 R09866 RC00524 ko00000,ko00001,ko00199,ko01000 Viridiplantae 37QSJ@33090,3G8WW@35493,4JH5R@91835,COG2124@1,KOG0156@2759 NA|NA|NA Q Belongs to the cytochrome P450 family Pdr0g056000 3750.XP_008350953.1 3.7e-141 507.7 fabids Viridiplantae 2BXB9@1,2S3Q9@2759,37VRT@33090,3GJHV@35493,4JQ5T@91835 NA|NA|NA Pdr0g056010 3750.XP_008360127.1 0.0 1809.3 fabids Viridiplantae 28IBX@1,2QQNU@2759,37NWN@33090,3GDMJ@35493,4JGKY@91835 NA|NA|NA S N-terminal C2 in EEIG1 and EHBP1 proteins Pdr0g056020 3750.XP_008360129.1 4.3e-280 969.9 fabids 1.6.5.3,1.6.99.3 ko:K03942 ko00190,ko01100,ko04714,ko04723,ko04932,ko05010,ko05012,ko05016,map00190,map01100,map04714,map04723,map04932,map05010,map05012,map05016 M00143 R11945 RC00061 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 3.D.1.6 Viridiplantae 37IZ7@33090,3G8TC@35493,4JGXI@91835,COG1894@1,KOG2658@2759 NA|NA|NA C Core subunit of the mitochondrial membrane respiratory chain NADH dehydrogenase (Complex I) that is believed to belong to the minimal assembly required for catalysis. 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read codons beginning with adenine. 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In type I primary cell wall, galacturonic acid residues of pectin can be acetylated at the O-2 and O-3 positions. 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